Assessing the Biosecurity Risk of Footwear as a Fomite for Transmission of Adventitious Infectious Agents to Mice
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The soles of staff shoes accessing vivaria can become contaminated on urban streets, potentially serving as a source of fomite-mediated transmission of adventitious agents to laboratory rodents. While shoe covers may mitigate this risk, donning them can lead to hand contamination. Staff accessing our vivaria use motor-driven shoe cleaners hundreds of times daily to remove and collect particulates via a vacuum collection system from the top, sole, and sides of shoes instead of shoe covers. Shoe cleaner debris (SCD) and contact media (CM) exposed to SCD from shoe cleaners in 5 vivaria were assessed by PCR for 84 adventitious agents. SCD and CM samples tested positive for 33 and 37 agents, respectively, and a combined 39 agents total. To assess SCD infectivity, NSG and Swiss outbred mice were housed for 7 days in direct contact with SCD and oronasally inoculated with a suspension created from SCD collected from each of the 5 vivaria. Mice were tested by PCR and serology 3-, 7-, 14- and 63-days post-inoculation. All mice remained healthy until the study’s end and tested negative for all agents found in SCD/CM except murine astrovirus 1, Staphyloccocus xylosus and Candidatus Savagella , agents known to be enzootic in the experimental mouse source colony. In a follow-up study, the soles of 27 staff street shoes were directly sampled using CM. Half of CM was used for PCR, while the other half was added as bedding material to a cage containing NSG and Swiss outbred mice. While CM tested positive for 11 agents, all mice were healthy 63 days post-exposure and again positive for only enzootic agents. These results suggest that shoe debris might not be a significant biosecurity risk to laboratory mice, questioning the need for shoe covers or cleaners when entering experimental barrier vivaria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».