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Enregistrement W4404016752 · doi:10.1101/2024.10.29.620998

Tunable differentiation of human CD4+ and CD8+ T cells from pluripotent stem cells

2024· preprint· en· W4404016752 sur OpenAlexaff
Ross D. Jones, Kevin Salim, Laura N Stankiewicz, John M. Edgar, Jana Gillies, Lauren J. Durland, Divy Raval, Thristan P. Taberna, Han Hsuan Hsu, Carla Zimmerman, Yale S. Michaels, Fábio Rossi, Megan K. Levings, Peter W. Zandstra

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCAR-T cell therapy research
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellHuman Induced Pluripotent Stem CellsStem cellCell biologyCD8BiologyEmbryonic stem cellGeneticsImmune systemGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Allogeneic T cell therapies are a highly desirable option to circumvent the cost and complexity of using autologous T cells to treat diseases. Allogeneic CD8+ T cells can be made from pluripotent stem cells (PSCs), but deriving CD4+ T cells from PSCs remained a significant challenge. Using feeder- and serum-free conditions, we found that CD4+ versus CD8+ T cell commitment from PSCs can be controlled by fine-tuning the dynamics of Notch and T cell receptor signaling delivered to CD4+CD8+ double positive T cells. Notch signaling negatively impacts CD4+ T cell commitment, and its timed removal allows generation of clonally-diverse and expandable CD4+ T cells from PSCs. The resulting CD4+ T cells respond to cytokine-mediated polarization by differentiating into Th1, Th2, or Th17 cells, recapitulating canonical helper cell function. These findings represent a significant step towards using PSC-derived CD4+ T cells as a low cost, off-the-shelf, cell therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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