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Enregistrement W4404018720 · doi:10.1101/2024.11.01.621598

Insight Into the Molecular Parameters of PEI Promoting an Efficient Gene Delivery into Cells

2024· preprint· en· W4404018720 sur OpenAlexfundno aff
Paulina González, Sylvain Tranchimand, Manon Rochedy, Patricia Leroyer, Jean‐Paul Chapel, Soizic Chevance, Christophe Schatz, Fabienne Gauffre, Pascal Loyer, Lourdes Mónica Bravo‐Anaya

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Circulatory and Respiratory HealthCentre National de la Recherche ScientifiqueInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésGene deliveryComputational biologyGeneNanotechnologyChemistryBiologyGenetic enhancementMaterials scienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The development of natural or synthetic polycations able to interact with nucleic acids and condense them into nanoparticles known as polyplexes, faces several unresolved challenges at the cellular level. Key issues include the intracellular trafficking of polyplexes, the endosomal escape and the release of nucleic acids into the cytosol, which are considered major bottlenecks for efficient protein expression. Here, we aim at gaining fundamental insights into the stability of polyplexes in biological media and their uptake and intracellular trafficking, while correlating data of the expression of reporter protein with both the molecular characteristics of various poly(ethylenimines) (PEI) and the physicochemical characteristics of PEI/peGFP-C3 polyplexes. For this, we chosen four samples of PEI, selected as a model polycation, with different molecular weights (Mw = 0.8, 20, 25 and 60 kg/mol) and structures (linear and branched). We found that the in vitro and in vivo stability of PEI/peGFP-C3 polyplexes, their cell internalization and transfection efficiency is dependent on the variation of polycation Mw and structure, as well as the intrinsic properties of polyplexes, such as the charge ratio (R=[N + ]/[P − ]). A relation between the percentage of positive cells to green fluorescent protein (GFP) and the amount of internalized nucleic acid (cyanine 5-peGFP-C3) allowed revealing the molecular characteristics of PEI promoting both higher both cell internalization and GFP expression on HEK293T cells. In the long term, the outcome of this work will be to propose guidelines to help design more effective, and less cytotoxic non-viral gene carriers with a great potential for new therapeutic applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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