An Investigation of the Structures of [(Glycine)(1‐Methyluracil)]M<sup>+</sup> Complexes (M=H, Li, Na, K) in the Gas Phase by IRMPD Spectroscopy and Theoretical Methods
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The presence of ions in the complexation of molecules can profoundly affect the structure, resulting in changes to functionality and stability. These non‐covalent interactions drive many biological processes both necessary and inimical and require extensive research to understand and predict their effects. Protonated and alkali metalated complexes of glycine (Gly) and 1‐methyluracil (1‐mUra) were studied using infrared multiphoton dissociation (IRMPD) spectroscopy and density functional theory (DFT) calculations. The experimental and simulated vibrational spectra were compared to help elucidate the structure of each complex. The lowest energy structure for [(Gly)(1‐mUra)]H + consists of amine protonated Gly bound to O4 of canonical 1‐mUra through a single ionic hydrogen bond with another, intraglycine ionic hydrogen bond between the protonated amine group and the carbonyl oxygen. For [(Gly)(1‐mUra)]Li + , [(Gly)(1‐mUra)]Na + and [(Gly)(1‐mUra)]K + , the experimental spectra are most consistent with the metal cations binding in a trigonal planar geometry with 1‐mUra bound to the metal cation via the O4 carbonyl. In [(Gly)(1‐mUra)]Li + and [(Gly)(1‐mUra)]Na + , the metal cation is bound to canonical Gly via the carbonyl oxygen and amine nitrogen, but in [(Gly)(1‐mUra)]K + , Gly is bound through both oxygens and contains an intraglycine hydrogen bond from the hydroxyl to the amine nitrogen. It was found that the B3LYP/6‐31+G(d,p) vibrational spectra are most consistent with the experimental spectra, but M062X was better than B3LYP at determining the lowest‐energy structures.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».