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Enregistrement W4404035718 · doi:10.1101/2024.11.01.24316231

Discovery of a Novel Missense Mutation in the RIMS1 Gene Potentially Enhances the Severity of Retinitis Pigmentosa (RP) Caused by RP1 Mutation in Humans

2024· preprint· en· W4404035718 sur OpenAlexaff
José M. Lázaro-Guevara, Karen M. Garrido-Lopez, Laura Sofía Reyna Soberanis, Maria A. Sandoval-Vargas, Bryan-Josué Flores-Robles, José Luis Téllez-Arreola

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationRetinitis pigmentosaMutationGeneticsGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Retinitis pigmentosa (RP) is a genetically diverse disorder characterized by the progressive degeneration of photoreceptors, ultimately leading to vision impairment and potential blindness. Understanding the disease progression and developing effective therapies is challenging due to its complex genetic landscape. This study unveils a di-genic complexity in RP involving a novel missense mutation in the RIMS1 and RP1 genes, traditionally associated with Cone-Rod Dystrophy. This mutation potentially enhances the RP phenotype, particularly in cases caused by RP1 mutations. We conducted a comprehensive genetic analysis on a family with a severe form of RP, focusing on the combined effects of RIMS1 and RP1. Using a targeted gene panel of 322 inherited retinal dystrophy (IRD) genes, we discovered a significant interaction between the RIMS1 variant and RP1 mutation within the cohort. Interestingly, patients with identical mutations exhibited substantial disease severity and progression differences. This discrepancy was particularly apparent in Patient E_1, who experienced rapid vision decline, emphasizing the impact of the mutation when combined with RP1. Biological network analysis shed light on the intricate genetic interplay, indicating a complex mechanism of disease modulation. Our findings contribute to a more nuanced understanding of RP’s genetic heterogeneity. The RIMS1 variant may serve as a modifier of the disease phenotype. This discovery expands our comprehension of the genetic factors influencing RP and underscores the importance of considering digenic interactions in future research and therapy development for retinal dystrophies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,557

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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