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Enregistrement W4404051196 · doi:10.1101/2024.10.30.621176

Microtubule plus-end dynamics are tightly coupled to the turnover of the MOR1 polymerase

2024· preprint· en· W4404051196 sur OpenAlexaff
Ryan C. Eng, Laryssa Halat, C.L. Kuo, Aida Rakei, Cecily D Costain, Ron Blutrich, Bettina Lechner, Ankit Walia, José M. Alonso, Daniel Coombs, Geoffrey O. Wasteneys

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDynamics (music)Cell biologyChemistryPhysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT MOR1/XMAP215/Dis1/Stu2 family proteins function as polymerases that promote microtubule assembly through tubulin-interacting N-terminal tumor-overexpressed gene (TOG) domains. It remains unclear how the polymerase activity of these proteins is coordinated with their movement along the growing microtubule lattice. Previously, it was found that a L174F mutation in the N-terminal TOG domain of the 217 kDa Arabidopsis thaliana MICROTUBULE ORGANIZATION 1 (MOR1) protein impaired microtubule growth and shrinkage rates in a temperature-dependent manner. In this study, we used a homologous recombination strategy to generate stable transgenic lines expressing full-length MOR1 and mutant mor1-1 L174F proteins tagged with the yellow fluorescent protein YPet. When expressed in mor1 mutant backgrounds, MOR1-3xYPet showed strong association with both the growing and shrinking microtubule plus ends, consistent with its involvement in both polymerization and depolymerization. By contrast, when expressed in a wild-type background, MOR1-3xYPet was redistributed along the microtubule lattice, microtubule growth rates were reduced, and plant growth was stunted. By quantifying fluorescence recovery after photobleaching, we confirmed that MOR1 has greater affinity for the plus end than the lattice. Exploiting the FRAP technique further, we identified a positive and linear correlation between microtubule polymerization rates and MOR1 turnover at the microtubule plus end. When microtubule growth rates were reduced in the mor1-1-YPet line by shifting the temperature from 21 to 30°C and for MOR1-3xYPet under taxol treatments, MOR1’s turnover was delayed. In contrast, microtubule growth rates and MOR1 turnover were hastened at 30°C or after CRISPR/Cas9-mediated knock out of the CLASP protein. These findings support a new model whereby MOR1 has finite processivity on the microtubule, catalyzing a limited fixed number of tubulin additions before dissociation. HIGHLIGHTS MOR1 has high affinity for both growing and shrinking microtubule plus ends, consistent with a function in both polymerization and depolymerization events. MOR1 has greater affinity for microtubule plus ends than the lattice, and lattice binding associated with overexpression is detrimental to plant growth. MOR1 transiently associates with the microtubule plus end, the duration of which is tightly coupled with its polymerase activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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