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Enregistrement W4404064412 · doi:10.1136/jitc-2024-sitc2024.0361

361 Early differentiation and memory transcription programs drive long-term persistence of NY-ESO-1 specific TCR-T cells in adoptive cell therapy

2024· article· en· W4404064412 sur OpenAlexaff
Marcus O Butler, Valentin Sotov, Dong-Hoon Han, Sam Saibil, Sarah Boross-Harmer, Linh T. Nguyen, Elizabeth Scheid, Dalam Ly, Sawako Elston, Meng Xu, Pamela S. Ohashi, Shinya Tanaka, Naoto Hirano

Notice bibliographique

RevueRegular and Young Investigator Award Abstracts · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCAR-T cell therapy research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésT-cell receptorTerm (time)Persistence (discontinuity)BiologyComputer scienceT cellImmunologyPhysicsEngineeringImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Background</h3> Adoptive transfer of T cell receptor gene-engineered T (TCR-T) cells can induce durable anti-cancer responses. TBI-1301 is a novel gene therapy produced by engineering autologous lymphocytes to express an NY-ESO-1-specific TCR using a retrovirus vector encoding siRNA to silence endogenous TCR. In this study, we characterize long-lived persisting transferred TBI-1301 TCR-T cells following adoptive transfer at the single-cell level. <h3>Methods</h3> Patients eligible for the approved study (UHN REB 15-9534) included those with informed consent, HLA-A*02:01 or A*02:06 haplotype, and NY-ESO-1 expression by IHC. PBMCs were harvested and processed to generate engineered TBI-1301 TCR-T cells. Patients received an infusion of 5x10<sup>9</sup> cells on day 0 after lymphodepletion with cyclophosphamide (CY) alone (750 mg/m<sup>2</sup> on day -7 and -6) or in combination with fludarabine (FLU) (30 mg/m<sup>2</sup> on day -7 and -6). Endpoints included safety, efficacy, and biological correlates for persistence of TCR-T cells post-infusion. The TBI-1301 infusion product and persisting TBI-1301 TCR-T cells were assessed by multi-parameter flow cytometry, single-cell RNA and TCR sequencing analysis. <h3>Results</h3> Clinical activity of TBI-1301 has previously been described. In the CY only cohort, 5/9 experienced grade 1–2 CRS, and, for the CY/FLU cohort, 3/5 patients experienced grade 2 CRS. The RECIST response rate in synovial sarcoma patients, whose tumors express high levels of NY-ESO-1, was 28.6%. In patients receiving CY alone, persistence beyond 100 days was detected in 3 patients at low levels (0.03–0.05% of CD8 T cells). In contrast, higher levels of persistence (5.6–7.7% of CD8 T cells) were observed in 2 patients receiving CY/FLU. Long-lived TBI-1301 cells exhibited a naïve/memory phenotype expressing CD45RA and CCR7. Single cell RNA sequencing analysis enabled the tracking of the infused TBI-1301 T cells from day 0 to day 125, including clonotypic cells sharing the same TCR sequences. UMAP visualization revealed that persisting TCR-T are distinct from infused cells, with higher expression of TCF7, LEF1, and CCR7 in both peripheral CD8+ and CD4+ TCR-T cells. In CD8+ T cells on day 125, differentiation trajectories of endogenous and TCR-T cells were recapitulated using potential of heat diffusion for affinity-based transition embedding (PHATE) and Slingshot pseudotime. Single-cell gene signature scoring revealed that TCR-T cells were enriched with a Tstem gene signature, whereas endogenous T cells exhibited a Tpex gene signature. <h3>Conclusions</h3> These data demonstrate sustained persistence of infused TBI-1301 T cells. Understanding the cell states of persisting TCR-T cells provides valuable insights for developing combination approaches to enhance the efficacy of new therapeutics. <h3>Trial Registration</h3> ClinicalTrials. gov NCT02869217. <h3>Ethics Approval</h3> Subjects underwent informed consent to a University Health Network Research Ethics Board protocol, UHN REB # 15-9534.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,507
Score d'incertitude au seuil0,949

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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