Geographic variation in environmental Aspergillus and clinical outcomes in COPD
Notice bibliographique
Résumé
Background: Aspergillus-associated disease is associated with adverse outcomes in COPD. Environmental variation and individual exposure to Aspergillus in COPD remains unclear. Methods: Patients with COPD were recruited in 2 geographic locations, variable in climate and seasonality: Singapore (Sg) (n=43) and Vancouver (Van), Canada (n=12). Outdoor/Indoor air and surface dust in each participant’s home was prospectively assessed by metagenomic sequencing. Clinical data and environmental parameters including indoor temperature and humidity were concurrently assessed. Results: Indoor temperature (median: 21.7°C: Van vs 29.4: Sg, p<0.001) and relative humidity (median: 41.7%: Van vs 73.8%: Sg, p<0.001) were significantly lower in Vancouver relative to Singapore. Indoor Aspergillus species in the homes of patients with COPD varied between countries. A. terreus, A. mulundensis and A. novofumigatus predominated in Vancouver, while A. nidulans, A. aculeatinus, A. welwitschiae, A. awamori and A. pseudoglaucus predominated in Singapore. A. fumigatus was detected in both locations, and relative abundance positively correlated with exacerbation frequency in COPD, independent of location (r=0.27; p=0.003 in Sg and r=0.49; p=0.019 in Van). Conclusion: While several Aspergillus species vary by geographic region, A. fumigatus in the air are associated with COPD exacerbations, independent of geography or patient origin. Funding: This work is supported by the Singapore Ministry of Health’s National Medical Research Council under the Clinician-Scientist Individual Research Grant MOH-001356 (S.H.C) and a Clinician-Scientist Award MOH-000710 (S.H.C) and Transition Award MOH- 001275-00 (P.Y.T) and the Singapore Ministry of Education under its AcRF Tier 1 Grant (RT1/22) (S.H.C)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».