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Enregistrement W4404103923 · doi:10.1183/13993003.congress-2024.pa448

Predicting real-world response to mepolizumab in severe asthma using machine learning

2024· article· en· W4404103923 sur OpenAlexaff
Koyo Usuba, Lingjiao Zhang, Xinyang Liu, Tim Tian Yu Han, Natalie Nightingale, Ali Reza Tehrani‐Bagha, Shiyuan Zhang, Peter Howarth, Rafael Alfonso-Cristancho

Notice bibliographique

RevueEpidemiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensGlaxoSmithKline (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMepolizumabComputer scienceAsthmaMachine learningArtificial intelligenceMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mepolizumab reduces clinically significant exacerbations (CSE) in patients with severe asthma, but research is needed to better understand the factors driving response. This study aimed to identify predictors of mepolizumab response using machine learning. 122 variables from 685 patients of REALITI-A study were used as model inputs. Linear regression, random forest, and XGBoost were tested. The best performing algorithm based on R<sup>2</sup> was used to train the model to identify predictors of response, defined as CSE change between pre-exposure (1-year and run-in) and 1-year post-exposure. Shapley Additive Explanations (SHAP) ranked variables based on feature importance and estimated the direction of relationship between features and the outcome. The best performing algorithm was XGBoost (R<sup>2</sup>=0.83). The top 5 ranking predictors were: pre-exposure rates of CSE, body mass index (BMI), immunoglobulin E (IgE) levels, activity impairment, and baseline asthma control questionnaire (ACQ) score, with SHAP values of 2.25, 0.18, 0.12, 0.11 and 0.09, respectively (Figure 1). Furthermore, higher rates of pre-exposure CSE directly correlate, while higher BMI, activity impairment, and baseline ACQ scores inversely correlate with greater reductions in CSE. This study identified top predictors of response to mepolizumab and may facilitate developing a clinically relevant model to support improvement of outcomes for patients with severe asthma. <fig><object-id>erj;64/suppl_68/PA448/F1</object-id><object-id>F1</object-id><object-id>F1</object-id><graphic></graphic></fig>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,200
Score d'incertitude au seuil0,738

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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