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Enregistrement W4404106641 · doi:10.1001/jamacardio.2024.3738

Distinct Genetic Risk Profile in Aortic Stenosis Compared With Coronary Artery Disease

2024· letter· en· W4404106641 sur OpenAlexaff
Teresa Trenkwalder, Carlo Maj, Baravan Al‐Kassou, Radosław Dębiec, S. Doppler, Muntaser D. Musameh, Christopher P. Nelson, Pouria Dasmeh, Sandeep Grover, Katharina Knoll, Joonas Naamanka, Ify Mordi, Peter S. Braund, Martina Dreßen, Harald Lahm, Felix Wirth, Stephan Baldus, Malte Kelm, Moritz von Scheidt, Johannes Krefting, David Ellinghaus, Aeron M Small, Gina M. Peloso, Pradeep Natarajan, George Thanassoulis, James C. Engert, Line Dufresne, Andre Franke, Siegfried Görg, Matthias Laudes, Ulrike Nowak-Göttl, Mariliis Vaht, Andres Metspalu, Monika Stoll, Klaus Peter Berger, Costanza Pellegrini, Adnan Kastrati, Christian Hengstenberg, Chim C. Lang, Thorsten Kessler, Iiris Hovatta, Georg Nickenig, Markus M. Nöthen, Markus Krane, Heribert Schunkert, Johannes Schumacher, Mart Kals, Anu Reigo, Maris Teder‐Laving, Jan Gehlen, Tom R. Webb, Ann-Sophie Giel, Laura L. Koebbe, Nina Feirer, Maximilian Billmann, Sundar Srinivasan, Sebastian Zimmer, Ling Li, Chuhua Yang, Oleg Borisov, Matti Adam, Verena Veulemans, Michael Joner, Erion Xhepa

Notice bibliographique

RevueJAMA Cardiology · 2024
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilBritish Heart Foundation
Mots-clésMedicineGenome-wide association studyCoronary artery diseaseBiobankInternal medicineCardiologyBioinformaticsGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGenotypeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: Aortic stenosis (AS) and coronary artery disease (CAD) frequently coexist. However, it is unknown which genetic and cardiovascular risk factors might be AS-specific and which could be shared between AS and CAD. Objective: To identify genetic risk loci and cardiovascular risk factors with AS-specific associations. Design, Setting, and Participants: This was a genomewide association study (GWAS) of AS adjusted for CAD with participants from the European Consortium for the Genetics of Aortic Stenosis (EGAS) (recruited 2000-2020), UK Biobank (recruited 2006-2010), Estonian Biobank (recruited 1997-2019), and FinnGen (recruited 1964-2019). EGAS participants were collected from 7 sites across Europe. All participants were of European ancestry, and information on comorbid CAD was available for all participants. Follow-up analyses with GWAS data on cardiovascular traits and tissue transcriptome data were also performed. Data were analyzed from October 2022 to July 2023. Exposures: Genetic variants. Main Outcomes and Measures: Cardiovascular traits associated with AS adjusted for CAD. Replication was performed in 2 independent AS GWAS cohorts. Results: A total of 18 792 participants with AS and 434 249 control participants were included in this GWAS adjusted for CAD. The analysis found 17 AS risk loci, including 5 loci with novel and independently replicated associations (RNF114A, AFAP1, PDGFRA, ADAMTS7, HAO1). Of all 17 associated loci, 11 were associated with risk specifically for AS and were not associated with CAD (ALPL, PALMD, PRRX1, RNF144A, MECOM, AFAP1, PDGFRA, IL6, TPCN2, NLRP6, HAO1). Concordantly, this study revealed only a moderate genetic correlation of 0.15 (SE, 0.05) between AS and CAD (P = 1.60 × 10-3). Mendelian randomization revealed that serum phosphate was an AS-specific risk factor that was absent in CAD (AS: odds ratio [OR], 1.20; 95% CI, 1.11-1.31; P = 1.27 × 10-5; CAD: OR, 0.97; 95% CI 0.94-1.00; P = .04). Mendelian randomization also found that blood pressure, body mass index, and cholesterol metabolism had substantially lesser associations with AS compared with CAD. Pathway and transcriptome enrichment analyses revealed biological processes and tissues relevant for AS development. Conclusions and Relevance: This GWAS adjusted for CAD found a distinct genetic risk profile for AS at the single-marker and polygenic level. These findings provide new targets for future AS research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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