Theme 5 Human Cell Biology and Pathology
Notice bibliographique
Résumé
Background: The Montreal Neurological Institute's Clinical, Biological, Imaging and Genetic (CBIG) collection and patient registry has recruited almost 4000 participants across Canada with neurological conditions as well as healthy controls since 2016.Using the web based LORIS open source database, the open biobank integrates patient and sample data to help scientists around the world to run cutting-edge research projects within an Open Science framework, to advance the understanding of neurological diseases and discover new therapeutic ways to help fight neurological disorders.Objectives: The main objective is to collect de-identified biological material as well as clinical, imaging and genetic information from patients and controls to enable innovative research projects that will advance the understanding of neurological diseases and human health under the Open Science principles.Results: So far, C-BIG has collaborated with more than 100 academic and industrial partners.Each partner has to give a summary data report on the use of samples within an adjustable period of time if no publication has arisen.The Neuro's C-BIG repository is using an open version of LORIS (Open Portal) for data access, including a Data Query Tool for scientists.Three different levels of access are available: Open, Registered and Controlled.Discussion: The C-BIG Repository hopes to improve and facilitate the material and data collection and sharing under the Open Science principles.The long-term goal is to reinforce the recruitment of participants across the world, by integrating the most information possible of these participants in the multimodal database to have a broader picture of neurological disorders, and accelerating research.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,059 | 0,016 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».