Characterizing CD38 expression in terminally differentiated B cells using variable lymphocyte receptor B tetramers
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: CD38 is an ectoenzyme receptor found on hematopoietic cells and its expression is used in the flow cytometric analysis of sub-populations of circulating B cells among peripheral blood mononuclear cells (PBMC) to aid in diagnosing patients with different antibody production defects (AbD). Monoclonal antibodies derived from the sea lamprey Variable Lymphocyte Receptor B (VLRB) are emerging as an alternative to conventional mammalian antibodies. We hypothesized that VLRB MM3 (V-CD38) which specifically recognizes CD38 in a manner correlating with its enzymatic activity could identify terminally differentiated B cells in human PBMC. Here we investigate the ability of V-CD38 as a tool to diagnose patients with diverse immune abnormalities including AbD. Methods: transitional B cells in PBMC was analyzed by flow cytometry using V-CD38 and compared with a commercial conventional antibody to CD38 (C-CD38). Results: A highly significant correlation (p<0.001, r=0.99) between the percentages of plasmablasts recognized by V-CD38 and C-CD38 was observed among 36 healthy controls (HC), 7 patients with AbD and 24 allergic individuals (AI). The use of V-CD38 enabled improved gating of the CD38 expressing cells (CD38+), aiding in the observation that patients with AbD had significantly lower (p=0.002) CD38+ plasmablasts (0.13%±0.13%) than HC (0.52%±0.57%). Only 61.3% of the transitional B cells detected by C-CD38 were also recognized by V-CD38 (r=0.95, p<0.001) among the 67 participants. AI had significantly reduced V-CD38 and C-CD38 transitional cells compared to HC (p=0.026 and p=0.012, respectively). Conclusions: V-CD38 is a novel reagent that can assess B cells in human PBMC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».