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Enregistrement W4404148479 · doi:10.1007/s00262-024-03862-8

Spontaneous high clonal expansion of Wilms’ tumor gene 1-specific cytotoxic T-lymphocytes in patients with Wilms’ tumor gene 1-expressing solid tumor

2024· article· en· W4404148479 sur OpenAlexaff
Soyoko Morimoto, Yukië Tanaka, Jun Nakata, Fumihiro Fujiki, Kana Hasegawa, Hiroko Nakajima, Sumiyuki Nishida, Akihiro Tsuboi, Naoki Hosen, Naoki Kagawa, Motohiko Maruno, Akira Myoui, Takayuki Enomoto, Shuichi Izumoto, Mitsugu Sekimoto, Naoya Hashimoto, Toshiki Yoshimine, Atsushi Kumanogoh, Yusuke Oji, Yoshitaka Oka, Haruo Sugiyama

Notice bibliographique

RevueCancer Immunology Immunotherapy · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceOsaka University
Mots-clésWilms' tumorCytotoxic T cellCancer researchGeneSolid tumorBiologyMedicinePathologyCancerGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Wilms’ tumor protein 1 (WT1)-targeted immunotherapy has been used in patients with leukemia and solid tumors. However, the spontaneous WT1-specific immune response before WT1 peptide vaccination in patients with WT1-expressing tumors (PTs) remains unclear. Therefore, we investigated whether WT1-specific cytotoxic CD8 + T-lymphocytes (CTLs) are clonally expanded in the peripheral blood outside of tumor sites. Clonal expansion of WT1 126 peptide (a.a.126–134)-specific CTLs (WT1 126 -CTLs) was compared between seven PTs and five healthy volunteers (HVs), and their T-cell receptors (TCRs) were analyzed at the single-cell level. Overall, 433 and 351 TCR β-chains of WT1 126 -CTLs were detected from PTs and HVs, respectively, and complementarity-determining region 3 was sequenced for clonality analysis. The frequencies of WT1 126 -CTLs were higher in human leukocyte antigen (HLA)-A*02:01 + PTs than in HLA-A*02:01 + HVs, although the difference was not statistically significant. WT1 126 -CTLs of differentiated types, including memory and effector, were higher in PTs than in HVs; whereas, those of the naïve type were higher in HVs than in PTs. WT1 126 -CTL clonality was significantly higher in PTs than in HVs. Furthermore, the frequency of effector WT1 126 -CTLs positively correlated with WT1 126 -CTL clonality in PTs; whereas, the frequency of naïve phenotype WT1 126 -CTLs tended to be negatively correlated with clonality. In conclusion, these results suggest that the WT1 protein in tumor cells is highly immunogenic, thereby stimulating endogenous naïve-type WT1 126 -CTLs and enabling them to clonally expand and differentiate into effector-type WT1 126 -CTLs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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