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Enregistrement W4404159889 · doi:10.1111/eva.70032

Genetics in the Ocean's Twilight Zone: Population Structure of the Glacier Lanternfish Across Its Distribution Range

2024· article· en· W4404159889 sur OpenAlexafffund
María Quintela, Eva García‐Seoane, Geir Dahle, Thor A. Klevjer, Webjørn Melle, Roger Lille‐Langøy, François Besnier, Konstantinos Tsagarakis, Maxime Geoffroy, Naiara Rodríguez‐Ezpeleta, David Côté, Sofie Knutar, Laila Unneland, Espen Strand, Kevin A. Glover

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesArcticNet
Mots-clésBiologyGlacierRange (aeronautics)Distribution (mathematics)TwilightEcologyOceanographyPhysical geographyPaleontologyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The mesopelagic zone represents one of the few habitats that remains relatively untouched from anthropogenic activities. Among the many species inhabiting the north Atlantic mesopelagic zone, glacier lanternfish ( Benthosema glaciale ) is the most abundant and widely distributed . This species has been regarded as a potential target for a dedicated fishery despite the scarce knowledge of its population genetic structure. Here, we investigated its genetic structure across the North Atlantic and into the Mediterranean Sea using 121 SNPs, which revealed strong differentiation among three main groups: the Mediterranean Sea, oceanic samples, and Norwegian fjords. The Mediterranean samples displayed less than half the genetic variation of the remaining ones. Very weak or nearly absent genetic structure was detected among geographically distinct oceanic samples across the North Atlantic, which contrasts with the low motility of the species. In contrast, a longitudinal gradient of differentiation was observed in the Mediterranean Sea, where genetic connectivity is known to be strongly shaped by oceanographic processes such as current patterns and oceanographic discontinuities. In addition, 12 of the SNPs, in linkage disequilibrium, drove a three clusters' pattern detectable through Principal Component Analysis biplot matching the genetic signatures generally associated with large chromosomal rearrangements, such as inversions. The arrangement of this putative inversion showed frequency differences between open‐ocean and more confined water bodies such as the fjords and the Mediterranean, as it was fixed in the latter for the second most common arrangement of the fjord's samples. However, whether genetic differentiation was driven by local adaptation, secondary contact, or a combination of both factors remains undetermined. The major finding of this study is that B. glaciale in the North Atlantic‐Mediterranean is divided into three major genetic units, information that should be combined with demographic properties to outline the management of this species prior to any eventual fishery attempt.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,142
Score d'incertitude au seuil0,275

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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