Opposing roles of SWI/SNF chromatin remodeling complex BAF and PBAF in Effector Differentiation during Chronic Viral Infection
Notice bibliographique
Résumé
Abstract During chronic viral infection, CD4+ T cells help in the form of IL-21 is critical for the development of highly cytolytic effector CD8+ T cells. However, the exact signaling pathways from IL-21 that regulate CD8+ T cell function remain unclear. The current dogma states that IL-21 predominantly signals through STAT3, to generate effector CD8+ T cells during chronic viral infection. Here, we reveal a novel mechanism of IL-21 signaling via STAT4 for effector CD8+ T cell development following chronic LCMV infection. Furthermore, STAT4-mediated effector differentiation is epigenetically regulated by BAF, a SWI/SNF chromatin remodeling complex. In the absence of either STAT4 or BAF, virus specific CD8+ T cells fail to differentiate into highly cytolytic effector CD8+ T cells capable of controlling viral infection. The effector differentiation phenotype is balanced by PBAF, another component of the SWI/SNF complex, which promotes CD8+ T cell exhaustion during chronic LCMV infection. Conditional knockout of PBAF from CD8+ T cells impairs the development of T cell exhaustion, resulting in immunopathology and mortality of chronic LCMV-infected mice. Interestingly, this phenotype is dependent on the STAT4 and BAF-mediated transcriptional and chromatin changes. Overall, our findings underscore the delicate balance between effector and exhaustion pathways, governed by BAF and PBAF complex, to dictate the outcomes of immunopathology during chronic viral infections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».