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Enregistrement W4404169684 · doi:10.1101/2024.11.08.24316949

Reliability of large language model knowledge across brand and generic cancer drug names

2024· preprint· en· W4404169684 sur OpenAlexaff
Jack Gallifant, Shan Chen, Sandeep Jain, Pedro Moreira, Ümit Topaloĝlu, Hugo J.W.L. Aerts, Jeremy L. Warner, William La Cava, Danielle S. Bitterman

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReliability (semiconductor)Brand namesDrugComputer scienceNatural language processingBusinessMedicineAdvertisingPharmacologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose To evaluate the performance and consistency of large language models (LLMs) across brand and generic oncology drug names in various clinical tasks, addressing concerns about potential fluctuations in LLM performance due to subtle phrasing differences that could impact patient care. Methods This study evaluated three LLMs (GPT-3.5-turbo-0125, GPT-4-turbo, and GPT-4o) using drug names from the HemOnc ontology. The assessment included 367 generic-to-brand and 2,516 brand-to-generic pairs, 1,000 drug-drug interaction synthetic patient cases, and 2,438 immune-related adverse event (irAE) cases. LLMs were tested on drug name recognition, word association, drug-drug interaction (DDI) detection, and irAE diagnosis using both brand and generic drug names. Results LLMs demonstrated high accuracy in matching brand and generic names (GPT-4o: 97.38% for brand, 94.71% for generic, p < 0.0001). However, they showed significant inconsistencies in word association tasks. GPT-3.5-turbo-0125 exhibited biases favoring brand names for effectiveness (OR 1.43, p < 0.05) and being side-effect-free (OR 1.76, p < 0.05). DDI detection accuracy was poor across all models (<26%), with no significant differences between brand and generic names. Sentiment analysis revealed significant differences, particularly in GPT-3.5-turbo-0125 (brand mean 0.6703, generic mean 0.9482, p < 0.0001). Consistency in irAE diagnosis varied across models. Conclusions and Relevance Despite high proficiency in name-matching, LLMs exhibit inconsistencies when processing brand versus generic drug names in more complex tasks. These findings highlight the need for increased awareness, improved robustness assessment methods, and the development of more consistent systems for handling nomenclature variations in clinical applications of LLMs. Context Summary Key objective This study aimed to assess the consistency of large language models (LLMs) in handling brand and generic oncology drug names across various tasks, including drug-drug interaction detection and adverse event identification. Knowledge generated LLMs demonstrated high accuracy in matching brand and generic names but showed significant inconsistencies in more complex tasks. Notable, models exhibited significant differences in attributing brand versus generic names to positive terms and sentiment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,025
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,098
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0250,098
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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