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Enregistrement W4404184484 · doi:10.1186/s12874-024-02384-2

The optimal approach for retrieving systematic reviews was achieved when searching MEDLINE and Epistemonikos in addition to reference checking: a methodological validation study

2024· article· en· W4404184484 sur OpenAlexaff
Lena Heinen, Käthe Gooßen, Carole Lunny, Julian Hirt, Livia Puljak, Dawid Pieper

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Research Methodology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCochraneSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMEDLINESystematic reviewMedicineResearch designComputer scienceMedical physicsInformation retrievalStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Systematic reviews (SRs) are used to inform clinical practice guidelines and healthcare decision making by synthesising the results of primary studies. Efficiently retrieving as many relevant SRs as possible is challenging with a minimum number of databases, as there is currently no guidance on how to do this optimally. In a previous study, we determined which individual databases contain the most SRs, and which combination of databases retrieved the most SRs. In this study, we aimed to validate those previous results by using a different, larger, and more recent set of SRs. METHODS: We obtained a set of 100 Overviews of Reviews that included a total of 2276 SRs. SR inclusion was assessed in MEDLINE, Embase, and Epistemonikos. The mean inclusion rates (% of included SRs) and corresponding 95% confidence intervals were calculated for each database individually, as well as for combinations of MEDLINE with each other database and reference checking. Features of SRs not identified by the best database combination were reviewed qualitatively. RESULTS: Inclusion rates of SRs were similar in all three databases (mean inclusion rates in % with 95% confidence intervals: 94.3 [93.9-94.8] for MEDLINE, 94.4 [94.0-94.9] for Embase, and 94.4 [93.9-94.9] for Epistemonikos). Adding reference checking to MEDLINE increased the inclusion rate to 95.5 [95.1-96.0]. The best combination of two databases plus reference checking consisted of MEDLINE and Epistemonikos (98.1 [97.7-98.5]). Among the 44/2276 SRs not identified by this combination, 34 were published in journals from China, four were other journal publications, three were health agency reports, two were dissertations, and one was a preprint. When discounting the journal publications from China, the SR inclusion rate in the recommended combination (MEDLINE, Epistemonikos and reference checking) was even higher than in the previous study (99.6 vs. 99.2%). CONCLUSIONS: A combination of databases and reference checking was the best approach to searching for biomedical SRs. MEDLINE and Epistemonikos, complemented by checking the references of the included studies, was the most efficient and produced the highest recall. However, our results point to the presence of geographical bias, because some publications in journals from China were not identified. STUDY REGISTRATION: https://doi.org/10.17605/OSF.IO/R5EAS (Open Science Framework).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,577
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,834
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,423
Score d'incertitude au seuil0,522

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,5770,834
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,023
Bibliométrie0,0420,032
Études des sciences et des technologies0,0050,005
Communication savante0,0120,014
Science ouverte0,0050,010
Intégrité de la recherche0,0050,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,983
Tête enseignante GPT0,729
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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