Regulation of magnesium ion transport in <i>Escherichia coli</i> : insights into the role of the 5’ upstream region in <i>corA</i> expression
Notice bibliographique
Résumé
In Escherichia coli, transport of magnesium ions across the cellular membrane relies on MgtA and CorA transporters. While the expression of mgtA is controlled by the two-component system PhoQ/PhoP and 5’ upstream region elements, corA expression is considered to be constitutive and not to depend on cellular factors. Importantly, the 5’ upstream region of corA is predicted to fold into structures highly similar to the magnesium-sensing mgtA 5‘ upstream region. Here using biochemical and genetic assays, we show that the intracellular concentration of magnesium ions affects corA expression. Similarly to mgtA, we find that the effect of magnesium ions on corA expression is mediated by the 5’ upstream region. We demonstrate that the RNA structure is important for regulation and that the Rho transcription factor is involved in the modulation of transcription termination. Consistent with previous studies, we find that translation of corL, a short ORF located within the 5’ upstream region, is important for corA regulation. Our data indicate that the efficiency of corL translation is inversely proportional to corA expression, similar to what has been described for mgtA and corA in Salmonella enterica. Using a novel assay to control the import of magnesium ions, we show that while the expression of mgtA is regulated by both extra- and intracellular magnesium ions, corA is regulated by variations in intracellular magnesium ions. Our results support a model in which the expression of corA is regulated by the 5’ upstream region that senses variations of intracellular magnesium ions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».