MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4404193227 · doi:10.1111/ctr.15478

Novel Scoring System for Ranking Hematopoietic Stem Cell Transplantation

2024· article· en· W4404193227 sur OpenAlexfundno aff
Lee Ann Baxter‐Lowe, Tao Wang, Michelle Kuxhausen, Stephen R. Spellman, Martin Maiers, Stephanie J. Lee, Jennifer N. Saultz, Esteban Arrieta‐Bolaños, Shahinaz M. Gadalla, Yung‐Tsi Bolon, Brian C. Betts

Notice bibliographique

RevueClinical Transplantation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHematopoietic Stem Cell Transplantation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen Research and DevelopmentNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesOffice of Naval ResearchAlexion Pharmaceuticalsbluebird bioPharmacyclicsTakeda OncologyActinium PharmaceuticalsU.S. Public Health ServiceAdaptive BiotechnologiesHealth Resources and Services AdministrationLegend BiotechCytoSen TherapeuticsDKMS FoundationMorphoSysSeagenPediatric Transplantation and Cellular Therapy ConsortiumCareDxBeiGeneSwedish Orphan BiovitrumAstellas PharmaGlaxoSmithKlineKiadis PharmaMedacJazz PharmaceuticalsMedical College of WisconsinAbbVieOmeros CorporationVertex PharmaceuticalsAtara BiotherapeuticsNational Cancer InstituteGilead SciencesNational Marrow Donor ProgramMallinckrodt PharmaceuticalsKyowa Hakko KirinMerckCSL BehringBristol-Myers SquibbAstraZenecaAstellas Pharma USGateway for Cancer ResearchAmgenNational Heart, Lung, and Blood InstituteNovartis Pharmaceuticals CorporationIncytePfizerSanofiHistoGenetics
Mots-clésMedicineHematopoietic stem cell transplantationTransplantationScoring systemStem cellHematopoietic cellHaematopoiesisRanking (information retrieval)OncologyImmunologyInternal medicineInformation retrievalGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: When human leukocyte antigen (HLA)-matched donors are not available for hematopoietic stem cell transplants (HSCT), there are no well-accepted guidelines for ranking 7/8 HLA-matched unrelated donors to achieve optimal transplant outcomes. A novel scoring system for ranking HLA mismatches for these donors was investigated. METHODS: High-resolution HLA types were used to determine amino acid mismatches located in the HLA antigen-recognition domain. The location and physicochemical properties of mismatched amino acids were used to assign scores for peptide binding, T-cell receptor docking, and HLA structure/function. The scores were tested using a cohort of 2319 patients with leukemia or myelodysplastic syndrome who received their first unrelated donor transplant using conventional graft-versus-host disease (GVHD) prophylaxis between 2000 and 2014. Donors were 7/8 HLA-matched with a single HLA Class I mismatch. Primary outcomes were overall survival and acute GVHD. RESULTS: The scores did not significantly (p < 0.01) associate with transplant outcomes, although a Peptide Score = 0 (i.e., no differences in peptide binding; N = 146, 6.3%) appears to have lower transplant-related mortality (TRM) compared to higher scores (p = 0.019). HLA mismatches with Peptide Score = 0 were predominately HLA-C*03:03/03:04 (62%), previously reported to be a permissive mismatch, and a group of 28 other HLA mismatches (38%) that showed similar associations with TRM. CONCLUSIONS: This study suggests that HLA mismatches that do not alter peptide binding or orientation (Peptide Score = 0) could expand the number of permissive HLA mismatches. Further investigation is needed to confirm this observation and to explore alternative scoring systems for ranking HLA mismatched donors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,696
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical TransplantationMême sujetHematopoietic Stem Cell TransplantationTravaux en français237 207