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Enregistrement W4404193431 · doi:10.1016/j.ebiom.2024.105441

Genomic insights for personalised care in lung cancer and smoking cessation: motivating at-risk individuals toward evidence-based health practices

2024· article· en· W4404193431 sur OpenAlexaff
Tony Chen, Giang Pham, Louis Fox, Nina Adler, Xiaoyu Wang, Jingning Zhang, Jinyoung Byun, Younghun Han, Gretchen Saunders, Dajiang J. Liu, Michael J. Bray, Alex T. Ramsey, James McKay, Laura J. Bierut, Christopher I. Amos, Xihong Lin, Haoyu Zhang, Li‐Shiun Chen

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesTaylor Family Institute for Innovative Psychiatric Research, Washington University School of Medicine in St. LouisNational Institute of General Medical SciencesNational Institute on Drug AbuseNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Human Genome Research InstituteWorld Health OrganizationNational Cancer InstituteNational Science FoundationNational Institutes of HealthNational Institute of Environmental Health SciencesIstituto Superiore di Sanità
Mots-clésSmoking cessationLung cancerMedicineCancerBioinformaticsOncologyBiologyInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Lung cancer and tobacco use pose significant global health challenges, necessitating a comprehensive translational roadmap for improved prevention strategies such as cancer screening and tobacco treatment, which are currently under-utilised. Polygenic risk scores (PRSs) may further motivate health behaviour change in primary care for lung cancer in diverse populations. In this work, we introduce the GREAT care paradigm, which integrates PRSs within comprehensive patient risk profiles to motivate positive health behaviour changes. METHODS: We developed PRSs using large-scale multi-ancestry genome-wide association studies and standardised PRS distributions across all ancestries. We validated our PRSs in 561,776 individuals of diverse ancestry from the GISC Trial, UK Biobank (UKBB), and All of Us Research Program (AoU). FINDINGS: Significant odds ratios (ORs) for lung cancer and difficulty quitting smoking were observed in both UKBB and AoU. For lung cancer, the ORs for individuals in the highest risk group (top 20% versus bottom 20%) were 1.85 (95% CI: 1.58-2.18) in UKBB and 2.39 (95% CI: 1.93-2.97) in AoU. For difficulty quitting smoking, the ORs (top 33% versus bottom 33%) were 1.36 (95% CI: 1.32-1.41) in UKBB and 1.32 (95% CI: 1.28-1.36) in AoU. INTERPRETATION: Our PRS-based intervention model leverages large-scale genetic data for robust risk assessment across populations, which will be evaluated in two cluster-randomised clinical trials. This approach integrates genomic insights into primary care, promising improved outcomes in cancer prevention and tobacco treatment. FUNDING: National Institutes of Health, NIH Intramural Research Program, National Science Foundation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,041
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,041
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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