Characterization of a plant‐pathogenic <scp>T3SS</scp> ‐lacking <i>Xanthomonas</i> strain isolated from common ragweed
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Common ragweed ( Ambrosia artemisiifolia ) is one of the leading causes of allergenic rhinitis, as well as a major weed of many crops. Biological control with plant pathogens, such as fungi and bacteria, represents an attractive alternative to the application of synthetic herbicides to control this noxious weed. In this study, we isolated a Xanthomonas strain (designated as 10‐10) from a diseased common ragweed plant collected in southern Quebec, Canada. We characterized the bioherbicidal potential of this strain against common ragweed, and determined whether it can infect other plant species. Its genome was sequenced using PacBio's SMRT technology, enabling us to gain insight into the phylogenetic placement of this strain within the genus Xanthomonas , and to study the repertoire of virulence‐associated genes and clusters. Xanthomonas sp. 10‐10 belongs to a clearly defined subclade within clade C (group 2), which includes X . vesicatoria , X . dyei and X . pisi . While this strain is closely related to X . pisi , it represents a new species within the genus Xanthomonas . Surprisingly, this strain lacks a type III secretion system, which is the main virulence determinant in pathogenic Xanthomonas spp., but harbours an arsenal of cell wall‐degrading enzymes. The addition of the organosilicone surfactant Silwet L‐77 drastically increased the disease symptoms caused by Xanthomonas sp. 10‐10 on common ragweed plants grown under controlled conditions, but the plants remained alive. This strain also caused disease symptoms on tomato, pepper and lettuce. More research is needed to develop Xanthomonas ‐based bioherbicide specifically targeting common ragweed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».