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Enregistrement W4404201647 · doi:10.1111/ppa.14020

Characterization of a plant‐pathogenic <scp>T3SS</scp> ‐lacking <i>Xanthomonas</i> strain isolated from common ragweed

2024· article· en· W4404201647 sur OpenAlexafffundabout
Adrien Biessy, Mélanie Cadieux, Marie Ciotola, Florence McDuff, Brahim Soufiane, Martin Laforest, Martin Filion

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeMcGill UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésRagweedBiologyMicrobiologyXanthomonasStrain (injury)Xanthomonas oryzaeVirulenceBacteriaPathogenGeneImmunologyGeneticsAllergy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Common ragweed ( Ambrosia artemisiifolia ) is one of the leading causes of allergenic rhinitis, as well as a major weed of many crops. Biological control with plant pathogens, such as fungi and bacteria, represents an attractive alternative to the application of synthetic herbicides to control this noxious weed. In this study, we isolated a Xanthomonas strain (designated as 10‐10) from a diseased common ragweed plant collected in southern Quebec, Canada. We characterized the bioherbicidal potential of this strain against common ragweed, and determined whether it can infect other plant species. Its genome was sequenced using PacBio's SMRT technology, enabling us to gain insight into the phylogenetic placement of this strain within the genus Xanthomonas , and to study the repertoire of virulence‐associated genes and clusters. Xanthomonas sp. 10‐10 belongs to a clearly defined subclade within clade C (group 2), which includes X . vesicatoria , X . dyei and X . pisi . While this strain is closely related to X . pisi , it represents a new species within the genus Xanthomonas . Surprisingly, this strain lacks a type III secretion system, which is the main virulence determinant in pathogenic Xanthomonas spp., but harbours an arsenal of cell wall‐degrading enzymes. The addition of the organosilicone surfactant Silwet L‐77 drastically increased the disease symptoms caused by Xanthomonas sp. 10‐10 on common ragweed plants grown under controlled conditions, but the plants remained alive. This strain also caused disease symptoms on tomato, pepper and lettuce. More research is needed to develop Xanthomonas ‐based bioherbicide specifically targeting common ragweed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,810
Score d'incertitude au seuil0,684

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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