BIOM-25. MOLECULAR PROFILING PREDICTS EARLY AND LATE PROGRESSION IN GLIOBLASTOMA
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Patients with glioblastoma experience a wide variation in response to standard treatment, with nearly 30% experiencing tumour progression during treatment, and nearly 6% surviving more than 5 years. To date, there are few non-invasive clinical biomarkers to predict response to first – line treatment. Chemical exchange saturation transfer (CEST) MRI may have the potential to fill this gap. CEST MRI is sensitive to treatment-induced changes and changes in tumor metabolism. Our team has obtained CEST data for patients before, during and after the end of standard chemoradiation treatment, and found that CEST provides markers of early response and can identify early, standard and late progressors before treatment initiation. In this study, we aimed to establish molecular profiles of early, standard and late progressors with IDH wild-type glioblastoma. Patients (n=180) with primary, IDH wild-type glioblastoma were imaged with CEST-MRI at multiple time points throughout standard chemoradiation treatment. DNA and RNA were co-extracted from matched normal and tumour pairs and processed for whole genome sequencing, enzymatic methyl-seq and gene expression analysis using Nanostring. Clinical variables such as age, extent of resection, sex, ECOG status and MGMT promoter methylated were also collected. A survival analysis was conducted using the Kaplan-Meier method with log-rank tests. Univariate and multi-variate hazard ratios for clinical variables were calculated by fitting Cox Proportional Hazards Models. Early progressors reported a median progression-free survival (PFS) of 142 days compared to 832 days in late progressors (p<0.0001). Early progressors also harbored distinct and statistically significant differences in gene expression and genomic alterations, namely in DNA damage repair, glucose transport and arginine metabolism pathways. A gene signature was prognostic of PFS and overall survival. Collectively, this data has the potential to serve as a radiogenomic biomarker to assess treatment response before or within early phases of treatment and allow for individual tailoring of the treatment plan.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».