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Enregistrement W4404239712 · doi:10.7554/elife.101950.1.sa1

Reviewer #1 (Public review): From histology to macroscale function in the human amygdala

2024· peer-review· en· W4404239712 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueCognitive Abilities and Testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsSavoy Foundation
Mots-clésHistologyAmygdalaPsychologyNeuroscienceMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The amygdala is a subcortical region in the mesiotemporal lobe that plays a key role in emotional and sensory functions. Conventional neuroimaging experiments treat this structure as a single, uniform entity, but there is ample histological evidence for subregional heterogeneity in microstructure and function. The current study characterized subregional structure-function coupling in the human amygdala, integrating post mortem histology and in vivo MRI at ultrahigh fields. Core to our work was a novel neuroinformatics approach that leveraged multiscale texture analysis as well as non-linear dimensionality reduction techniques to identify salient dimensions of microstructural variation in a 3D post mortem histological reconstruction of the human amygdala. We observed two axes of subregional variation in the human amygdala, describing inferior-superior as well as medio-lateral trends in microstructural differentiation that in part recapitulated established atlases of amygdala subnuclei. We then translated our approach to in vivo MRI data acquired at 7 Tesla, and could demonstrate generalizability of these spatial trends across 10 healthy adults. We then cross-referenced microstructural axes with functional blood-oxygen-level dependent (BOLD) signal analysis obtained during task-free conditions, and demonstrated a close association of structural axes with macroscale functional network embedding, notably the temporo-limbic, default mode, and sensory-motor networks. Our novel multiscale approach consolidates descriptions of amygdala anatomy and function obtained from histological and in vivo imaging techniques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,060
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,407
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,940
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0600,407
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0080,005
Science ouverte0,0060,005
Intégrité de la recherche0,0160,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0710,031

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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