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Enregistrement W4404243398 · doi:10.1084/jem.20240546

Human <i>ITGAV</i> variants are associated with immune dysregulation, brain abnormalities, and colitis

2024· article· en· W4404243398 sur OpenAlexafffund
Sina Ghasempour, Neil Warner, Rui Guan, Marco M. Rodari, Danton Ivanochko, Ryder Whittaker Hawkins, Ashish Marwaha, Jan Krzysztof Nowak, Yijing Liang, Daniel J. Mulder, Lorraine Stallard, Michael Li, Daoqi Yu, Fred G. Pluthero, Vritika Batura, Mo Zhao, Iram Siddiqui, Julia Upton, Jessie M. Hulst, Walter H.A. Kahr, Roberto Mendoza‐Londono, Fabienne Charbit‐Henrion, Lies H. Hoefsloot, Anis Khiat, D. A. A. MOREIRA, Eunice Trindade, Maria do Céu Espinheira, Isabel Pinto Pais, Marjolein J.A. Weerts, Hannie Douben, Daniel Kotlarz, Scott B. Snapper, Christoph Klein, James J. Dowling, Jean‐Philippe Julien, Marieke Joosten, Nadine Cerf–Bensussan, Spencer A. Freeman, Marianna Parlato, Tjakko J. van Ham, Aleixo M. Muise

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of TorontoSickKids FoundationAlberta Children's HospitalUniversity of CalgaryHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchFondation Princesse Grace de MonacoGenome AlbertaHospital for Sick ChildrenNarodowe Centrum NaukiFondation pour la Recherche MédicaleOntario Genomics InstituteCanada Foundation for InnovationGenome British ColumbiaAgence Nationale de la RechercheGovernment of OntarioInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleOntario Research FoundationCanadian Institute for Advanced ResearchLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustNational Institutes of HealthCanada Research ChairsOntario GenomicsGenome Canada
Mots-clésImmune dysregulationImmune systemColitisMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Integrin heterodimers containing an Integrin alpha V subunit are essential for development and play critical roles in cell adhesion and signaling. We identified biallelic variants in the gene coding for Integrin alpha V (ITGAV) in three independent families (two patients and four fetuses) that either caused abnormal mRNA and the loss of functional protein or caused mistargeting of the integrin. This led to eye and brain abnormalities, inflammatory bowel disease, immune dysregulation, and other developmental issues. Mechanistically, the reduction of functional Integrin αV resulted in the dysregulation of several pathways including TGF-β-dependent signaling and αVβ3-regulated immune signaling. These effects were confirmed using immunostaining, RNA sequencing, and functional studies in patient-derived cells. The genetic deletion of itgav in zebrafish recapitulated patient phenotypes including retinal and brain defects and the loss of microglia in early development as well as colitis in juvenile zebrafish with reduced SMAD3 expression and transcriptional regulation. Taken together, the ITGAV variants identified in this report caused a previously unknown human disease characterized by brain and developmental defects in the case of complete loss-of-function and atopy, neurodevelopmental defects, and colitis in cases of incomplete loss-of-function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,656
Score d'incertitude au seuil0,489

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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