Abstract 4144528: The Polygenic Mechanisms of Dilated Cardiomyopathy Contribute to The Development of Tachycardia-Associated Cardiomyopathy in Patients With Atrial Tachyarrhythmias
Notice bibliographique
Résumé
Background Longstanding tachycardia can lead to reversible left ventricular (LV) systolic dysfunction called tachycardia-associated cardiomyopathy (TAC). It is unknown if there is a genetic predisposition to the development of TAC or whether there is overlap between the genetic pathways of TAC and dilated cardiomyopathy (DCM). Research Questions Is there a genetic predisposition towards the development of TAC in individuals with arrhythmia? If so, do these genetic pathways overlap with those of DCM? Methods/Approach The study is a single-center case control study performed at the Montreal Heart Institute (MHI). Inclusion criteria for TAC cases are shown in Table 1. All cases underwent array genotyping and exome sequencing. Previously genotyped controls with arrhythmia but no documented LV dysfunction were included from the MHI Biobank. Following imputation using the TOPMed imputation server, a polygenic score for DCM (PGS DCM ; PGS000666) was calculated for cases and controls. The rate of (likely) pathogenic variants in known cardiomyopathy genes was reported in cases. Results/Data (descriptive and inferential statistics) The study included 107 cases and 878 controls. Case characteristics are shown in Table 1. The average PGS DCM for cases was significantly higher than that of controls (p-value <10 -10 ; Figure 1). Logistic regression with correction for age, sex, and ancestry (principal components) showed a strong association of PGS DCM with TAC (OR 1.99, 95% CI 1.54-2.58; p-value <10 -6 ). Notably, among patients with atrial tachyarrhythmias, those with a PGS DCM above the 95 th percentile had a 3.53-fold increased risk of TAC (p-value 4.5 -4 ). Exome sequencing in TAC cases identified only 2/107 (2%) carriers of (likely) pathogenic variants (in cardiomyopathy genes TNNT2 and MYH7 ). Conclusions Pathogenic variants account for a small minority of TAC cases. In contrast, a significant association between PGS DCM and TAC is suggestive of a shared polygenic pathway between TAC and DCM.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».