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Enregistrement W4404298883 · doi:10.1371/journal.pone.0313407

Functional characterization of optic photoreception in Lymnaea stagnalis

2024· article· en· W4404298883 sur OpenAlexafffund
Alicia N. Harracksingh, Julia Bandura, Takefumi Morizumi, Philippe P. Monnier, Jeffrey T. Henderson, Zhong‐Ping Feng

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesTemerty Faculty of Medicine, University of TorontoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Mots-clésLymnaea stagnalisBiologyVisual phototransductionPhototaxisVertebrateModel organismSnailNeuroscienceEvolutionary biologyRetinaGeneEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Optic photoreception is a critical function for animal survival. Across the evolutionary spectrum, diverse animal models have been used to investigate visual system function and potential mechanisms under physiological or pathophysiological states. However less is known on photoreceptive behaviors and retinal processing in invertebrates, especially molluscs. This study focuses on the freshwater pond snail, Lymnaea stagnalis (L. stagnalis), to explore its visual function and underlying mechanisms. Using anatomical and histological approaches we characterized the L. stagnalis eye structure and demonstrated structural connections and retinal rhodopsin-positive sensory cells potentially critical for phototransduction. To assess the snail phototactic responses, we developed a new neurobehavioral protocol and employed DeepLabCut to track and quantify animal locomotion. We demonstrated that L. stagnalis exhibits a positive locomotory response to intense focal light and has diverse photo-locomotory responses. Further, we conducted phylogenetic and protein structure analyses and demonstrated that L. stagnalis has a unique repertoire of both vertebrate and invertebrate phototransduction genes. Further characterization of a rhodopsin-like gene identified unique characteristics compared to other mollusks and vertebrates, suggesting different mechanisms of phototransduction. Taken together, our work establishes L. stagnalis as a model organism for studying optic photoreception, offering new insights into the evolution and diversity of visual function across animal species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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