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Enregistrement W4404308088 · doi:10.2196/58797

Recent Use of Novel Data Streams During Foodborne Illness Cluster Investigations by the United States Food and Drug Administration: Qualitative Review

2024· review· en· W4404308088 sur OpenAlexvenueno aff
Michael C. Bazaco, Christina K. Carstens, Tiffany Greenlee, Tyann Blessington, Evelyn Pereira, Sharon L. Seelman, Stranjae Ivory, Temesgen Jemaneh, Margaret Kirchner, Alvin Crosby, Stelios Viazis, Sheila van Twuyver, Michael Gwathmey, Tanya Malais, Oliver Ou, Stephanie Kenez, Nichole Nolan, Andrew Karasick, Cecile Punzalan, Colin Schwensohn, Laura Gieraltowski, Cary Chen Parker, Erin Jenkins, Stic Harris

Notice bibliographique

RevueJMIR Public Health and Surveillance · 2024
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFood Safety and Hygiene
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFood and drug administrationCluster (spacecraft)PreprintEnvironmental healthAntimicrobial drugMedicineComputer scienceWorld Wide WebBiologyAntimicrobial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unlabelled: Foodborne illness is a continuous public health risk. The recognition of signals indicating a cluster of foodborne illness is key to the detection, mitigation, and prevention of foodborne adverse event incidents and outbreaks. With increased internet availability and access, novel data streams (NDSs) for foodborne illness reports initiated by users outside of the traditional public health framework have emerged. These include, but are not limited to, social media websites, web-based product reviews posted to retailer websites, and private companies that host public-generated notices of foodborne illnesses. Information gathered by these platforms can help identify early signals of foodborne illness clusters or help inform ongoing public health investigations. Here we present an overview of NDSs and 3 investigations of foodborne illness incidents by the US Food and Drug Administration that included the use of NDSs at various stages. Each example demonstrates how these data were collected, integrated into traditional data sources, and used to inform the investigation. NDSs present a unique opportunity for public health agencies to identify clusters that may not have been identified otherwise, due to new or unique etiologies, as shown in the 3 examples. Clusters may also be identified earlier than they would have been through traditional sources. NDSs can further provide investigators supplemental information that may help confirm or rule out a source of illness. However, data collected from NDSs are often incomplete and lack critical details for investigators, such as product information (eg, lot numbers), clinical or medical details (eg, laboratory results of affected individuals), and contact information for report follow-up. In the future, public health agencies may wish to standardize an approach to maximize the potential of NDSs to catalyze and supplement adverse event investigations. Additionally, the collection of essential data elements by NDS platforms and data-sharing processes with public health agencies may aid in the investigation of foodborne illness clusters and inform subsequent public health and regulatory actions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,119
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,300
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: Qualitatif
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil0,631

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1190,300
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0120,018
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0070,011
Science ouverte0,0030,011
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,237
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,157 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeQualitatif
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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