Characterization of variably protease-sensitive prionopathy by capillary electrophoresis
Notice bibliographique
Résumé
Variably Protease Sensitive Prionopathy (VPSPr) is a rare human prion disease that, like Creutzfeldt-Jakob disease (CJD), results in the deposition of abnormally folded prion protein aggregates in the brain and is ultimately fatal. Neuropathology and clinical features of VPSPr are heterogeneous. However, the key discriminating feature is the relative sensitivity of the pathological prion protein to proteinase digestion compared to that typically seen in other human prion cases. Three major fragments of 23, 17 and 7 kDa are characteristic of the disease following digestion with proteinase K. We recently reported the utility of the highly adaptive and reproducible ProteinSimple™ capillary electrophoresis (CE) system to perform protein separation of PK digested prion protein in CJD. Consequently, we explored capillary-based electrophoresis (CE) technology as a sensitive method to detect and characterize VPSPr in a cohort of 29 cases. The unique 7 kDa fragment has high intensity, particularly in cases with the codon 129 VV genotype, but can be missed by regular Western blotting due to the small size. However, this fragment is readily detected by CE in all cases. In addition, the flexibility of CE produced highly reproducible, semi-quantitative data for determining relative proteinase K sensitivity and epitope mapping of representative cases from each codon 129 genotype (VV, MV and MM).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».