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Enregistrement W4404322180 · doi:10.1002/gcc.70007

Differential Expression of Proteins and Genes at the Tumor‐Brain Interface in Invasive Meningioma

2024· article· en· W4404322180 sur OpenAlexaff
Kornwika Senglek, Chinachote Teerapakpinyo, Nutchawan Jittapiromsak, Pakrit Jittapiromsak, Irin Lertparinyaphorn, Paul S. Thorner, Shanop Shuangshoti

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMeningioma and schwannoma management
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesChulalongkorn University
Mots-clésBiologyMeningiomaImmunohistochemistryGeneCancerGene expressionCancer researchPathologyImmunologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most meningiomas are dural-based extra-axial tumors in close contact with the brain. Expression of genes and proteins at the tumor-brain interface in brain-invasive meningioma is basically unknown. Using the NanoString pan-cancer panel, differential expression of genes in the invasive edge versus main tumor body was determined in 12 invasive meningiomas (comprising the discovery cohort), and 6 candidate genes: DTX1, RASGRF1, GRIN1, TNR, IL6, and NR4A1, were identified. By immunohistochemistry, DTX1 and RASGRF1 expression correlated with gene expression, and were studied in an expanded cohort of 21 invasive and 15 noninvasive meningiomas, together with Ki-67. Significantly higher expression of DTX1, RASGFR1, and Ki-67 was found in the invasive edge compared with the main tumor body. Increased expression of RASGRF1 and Ki-67 was more clearly associated with brain invasion. The situation with DTX1 was less definitive since increased expression was observed in meningiomas both at the invasive edge and when in close contact with brain but without invasion. Pathway analyses identified significant links between DTX1 and RASGRF1 and key biological processes, including cell-cell adhesion, and signaling pathways including Notch, RAS, MAPK, and Rho. Higher expression of DTX1, RASGRF1, and Ki-67 in the brain-invasive area of meningiomas suggests that these proteins play a role in the process of brain invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,403

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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