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Enregistrement W4404328338 · doi:10.1111/nph.20233

Turnip mosaic virus selectively subverts a <scp>PR</scp>‐5 thaumatin‐like, plasmodesmal protein to promote viral infection

2024· article· en· W4404328338 sur OpenAlexafffund
Rong‐Rong He, Yinzi Li, Mark A. Bernards, Aiming Wang

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaWestern University
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTurnip mosaic virusPathosystemBiologyTobacco mosaic virusNicotiana benthamianaPlasmodesmaCalloseVirologyViral replicationLytic cycleCucumber mosaic virusCell biologyPlant virusTobamovirusViral proteinArabidopsis thalianaCucumovirusVirusMicrobiologyPathogenPotyvirusGeneticsCytoplasmGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogenesis-related (PR) proteins are induced by abiotic and biotic stresses and generally considered as part of the plant defense mechanism. However, it remains yet largely unclear if and how they are involved in virus infection. Our recent quantitative, comparative proteomic study identified three PR-5 family proteins that are significantly differentially accumulated in the plasmodesmata (PD)-enriched fraction isolated from Nicotiana benthamiana leaves infected by turnip mosaic virus (TuMV). In this study, we employed the TuMV-Arabidopsis pathosystem to characterize the involvement of two Arabidopsis orthologs, AtOSM34 and AtOLP of the three N. benthamiana PR-5-like proteins. We show that AtOSM34 and AtOLP are PD-localized proteins and their expression is up- and downregulated in response to TuMV infection, respectively. Deficiency or overexpression of AtOLP does not affect viral RNA accumulation. Knockdown of AtOSM34 inhibits TuMV infection, whereas its overexpression promotes viral infection. We further demonstrate that AtOSM34 functions as a proviral factor through diminishing PD callose deposition to promote viral intercellular movement, targeting the viral replication complex to enhance viral replication, and suppressing the ROS-mediated antiviral response. Taken together, these data suggest that TuMV has evolved the ability to selectively upregulate and subvert AtOSM34, a PR-5 family protein to assist its infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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