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Enregistrement W4404338630 · doi:10.1016/j.ekir.2024.11.004

Implementation of a Kidney Genetic Service Into the Diagnostic Pathway for Patients With Chronic Kidney Disease in Canada

2024· article· en· W4404338630 sur OpenAlexafffundabout
Clara Schott, Monica Arnaldi, Cadence Baker, Jian Wang, Adam D. McIntyre, Samantha Colaiacovo, Sydney Relouw, Gabriela Almada Offerni, Carla Campagnolo, Logan R. Van Nynatten, Ava Pourtousi, Alexa Drago-Catalfo, Victoria Lebedeva, Michael Chiu, Andrea Cowan, Guido Filler, Lakshman Gunaratnam, Andrew A. House, Susan Huang, Hariharan Iyer, Arsh K. Jain, Anthony M. Jevnikar, Khaled Lotfy, Louise Moist, Faisal Rehman, Pavel S Roshanov, Ajay Sharma, Matthew A. Weir, Kendrah Kidd, Anthony J. Bleyer, Robert A. Hegele, Dervla M. Connaughton

Notice bibliographique

RevueKidney International Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensVictoria HospitalPopulation Health Research InstituteLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchLondon Health Sciences CentreSchulich School of Medicine and Dentistry, Western UniversityWestern UniversityMuscular Dystrophy CanadaSchulich School of Medicine and DentistryAcademic Medical Organization of Southwestern Ontario
Mots-clésMedicineKidney diseaseKidneyDiseaseIntensive care medicineBioinformaticsInternal medicinePathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Genetic kidney disease (GKD) accounts for 10% to 20% of chronic kidney disease (CKD). Genetic testing using gene panel or targeted exome sequencing (ES) can confirm GKD; however, integration into clinical practice has been hampered by small studies, selective populations, and data predominately derived from research settings. Using prespecified clinical referral criteria and a diagnostic pipeline, we performed a prospective cohort study describing diagnostic efficacy and clinical utility of genetic assessment in patients with CKD. Methods: We analyzed a prospective cohort of 300 participants (256 families) referred to a kidney genetics clinic, between March 2020 and March 2024. Testing strategies included gene panels, and if negative or unsuitable, targeted ES analysis. Testing was performed for the detection of variants in genes known to cause CKD. Results: = 103/300) with comprehensive testing. The median time from first diagnosis of CKD to genetic assessment was long at 10.4 years. Following genetic assessment, the median time to receive a positive genetic result was 2.9 months. Multiple levels of clinical utility were recorded in patients receiving a genetic diagnosis, varying across CKD subtype. Conclusion: Instituting referral guidelines and a standardized testing algorithm established a genetic diagnosis in one-third of participants, providing insight into the viability of integrating genetic assessment in the CKD diagnostic pathway. Considering the potential for clinical utility, strategies to reduce the time from CKD diagnosis to genetics assessment are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,142
Score d'incertitude au seuil0,969

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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