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Enregistrement W4404355935 · doi:10.1016/j.cmpb.2024.108497

SlicerCineTrack: An open-source research toolkit for target tracking verification in 3D Slicer

2024· article· en· W4404355935 sur OpenAlexafffund
Teo Mesrkhani, Jacqueline Banh, Sayeed Jalil, M. Mohamed Sikkandar Afzal, Elodie Lugez

Notice bibliographique

RevueComputer Methods and Programs in Biomedicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOptical Imaging and Spectroscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésOpen sourceComputer scienceTracking (education)Software engineeringOperating systemHuman–computer interactionSoftwarePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Target motion monitoring plays a significant role in several computer-assisted interventions. However, ensuring the reliability of tracking algorithms can be challenging without adequate tools. We introduce SlicerCineTrack, a free open-source research toolkit, designed to provide users with a user-friendly interface for visualizing their target tracking results. SlicerCineTrack was developed as an extension to 3D Slicer. It enables users to visualize target tracking results by sequentially playing back cine medical images, and simultaneously overlaying the target segmentation at the locations indicated by the tracking results. The extension was evaluated by established experts in computer-assisted interventions and image-guided therapy. SlicerCineTrack is available for download from the 3D Slicer extension catalog for stable releases, and its GitHub repository for preview releases. Evaluation results demonstrate SlicerCineTrack’s effectiveness in discriminating between different tracking performances. Moreover, the experts found the extension convenient to use due to its intuitive and user-friendly interface. SlicerCineTrack was found to be effective at verifying the reliability of tracking algorithms. In turn, SlicerCineTrack shows potential for target tracking verification, as well as algorithm validation and refining through parameter tuning. • Open-source toolkit for target tracking verification in 3D Slicer. • Enables visualization of tracking results with cine images and segmentation overlays. • Evaluated by experts; found effective and user-friendly for tracking performance. • Facilitates algorithm validation and refinement. • Extends 3D Slicer functionalities to support cutting-edge research in CAI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,978
Score d'incertitude au seuil0,573

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,233
Tête enseignante GPT0,547
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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