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Enregistrement W4404359006 · doi:10.1161/circ.150.suppl_1.4144876

Abstract 4144876: Genetic evaluation of metabolic signatures associated with lipid-lowering medications

2024· article· en· W4404359006 sur OpenAlexaboutno aff
Pranav Sharma, Samuel Khodursky, Shuai Yuan, Scott M. Damrauer, Michael G. Levin

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet and metabolism studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePharmacologyBioinformaticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Human genetic studies have identified hundreds of risk loci for circulating lipoproteins, motivating the development of new lipid-lowering medications. Although these targets influence lipids and metabolites through unique mechanisms, the extent to which they exert shared pleiotropic effects on other effectors of atherosclerotic cardiovascular disease remains uncertain. This study explored the lipid subfraction, cytokine, and metabolic signatures associated with lipid-lowering targets using Mendelian Randomization (MR). Methods: The study focused on protein targets of novel lipid-lowering medications: PCSK9, APOB, LPA, LPL, and ANGPTL3. Instruments for PCSK9, LPL, and ANGPTL3 were derived from the UK Biobank Pharma Proteomics Project (54,219 participants), and for LPA and APOB from the Pan-UK Biobank (335,796 and 418,505 participants). These exposures were tested against outcomes including 40 cytokines (meta-analysis of 74,783 individuals), 249 lipid-subfraction measures (118,461 UK Biobank participants), and 1,400 metabolite measures (8,299 participants in the Canadian Longitudinal Study on Aging). Univariable MR was performed using the inverse-variance weighted (IVW) method to test associations. The Jaccard index quantified the similarity of effects of each target across these outcomes, focusing on significant results after adjusting for multiple testing (FDR q < 0.05). Results: The lipid-lowering targets were each significantly associated with between 1-17 cytokines, 184-220 lipid subfractions, and 307-396 metabolites (FDR q < 0.05). ANGPTL3 and PCSK9 showed the highest similarity of effects on lipid subfractions (Jaccard Index: 0.83, p < 0.001). LPA, APOB, and ANGPTL3 were the only targets with significant cytokine effects, with low similarity scores potentially suggesting their inflammatory signatures are unique. ANGPTL3 and LPA had the highest similarity of effects on metabolites (Jaccard Index: 0.19, p < 0.05). Conclusion: Our analyses indicate that lipid-lowering targets influence metabolic signatures through shared and unique mechanisms. Further exploration of how cytokine, lipid, and metabolic profiles are impacted may help in the development of more effective medications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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