Abstract 4143772: Genome wide association study meta-analysis of 19,487 individuals with mitral valve prolapse identifies 52 novel genomic regions and highlights pro-fibrosis genes
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Mitral valve prolapse (MVP) is the most common cause of primary mitral regurgitation and is estimated to affect between 1-3% of the general population. A subset of individuals with MVP develop malignant arrhythmias, often in the context of myocardial fibrosis. The genetics of MVP, and genetic factors explaining why only some individuals with MVP have adverse outcomes, remains poorly understood. Methods: We defined MVP using a combination of claims data and echocardiographic diagnosis across 15 cohorts spanning 5 countries and performed a meta-analysis of genome-wide association studies (GWAS) for MVP including 19,487 MVP cases among 2,247,054 individuals. Causal genes were prioritized using a combination of methods including the identification of variants in active promoters/enhancers using mitral valve ATAC-seq data from an external dataset. To determine whether prioritized genes may be differentially expressed in myocardial fibrosis, we compared single-cell RNA sequencing between fibrosed papillary muscles and normal left ventricular among two individuals with severe MVP. Results: There were 67 unique genome-wide significant (GWS; p<5x10 -8 ) genomic regions, of which 52 were novel. Of these, 38 GWS regions included either missense variants or variants overlapping a promoter active in valve tissue as suggested by mitral valve ATAC-seq data. Pathway analysis of prioritized genes highlighted etiological roles for extracellular matrix and cardiomyocyte biology. 33 prioritized genes were differentially expressed between fibrotic papillary muscle tissue and normal left ventricle, the majority of which were specific to cardiomyocytes. One of these genes, CAMK2D , was also observed as sub-GWS in a recent GWAS of myocardial interstitial fibrosis and has notable pleiotropy for arrhythmia traits including atrial fibrillation and atrioventricular block. Conclusions: We performed the largest GWAS of MVP to-date, discovering 52 novel GWS regions, and prioritized genes relevant to myocardial fibrosis, an important risk factor for adverse outcomes among individuals with MVP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,016 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».