Abstract 4142270: Epigenetics of Shared and Unique Pathways Associated with Atherogenic Lipoprotein Particle Content and Number Across the Early Adult Life Course
Notice bibliographique
Résumé
Intro: Exposure to atherogenic lipoproteins is a central determinant of atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD) events. Shared and unique biological pathways influence lipoprotein particle content (non-HDL-C, LDL-C) and number (apoB, LDL-P), but significant unexplained variance in blood lipoprotein levels remains. Understanding the associations between lipoprotein particle number, content, and repeated DNA methylation (DNAm) measures may provide novel insights into lipoprotein level determinants. Methods: We included 2962 participants from the Coronary Artery Risk Development in Young Adults study that had DNAm, LDL-C, non-HDL-C, apoB, and LDL-P measurements at exam years 15, 20, 25, and 30. Non-HDL-C and LDL-C were determined using standard laboratory technique. LDL particle number (LDL-P) and apoB were measured using NMR. DNAm was assessed using the Illumina Epic Array. We used separate mixed linear models adjusted for age, sex, race, and technical variables to quantify associations between DNAm sites and non-HDL-C, LDL-C, LDL-P, and apoB. We performed pathway analysis of DNAm located in gene promoter regions. We estimated % variance in lipid levels explained by associated DNAm sites using ANOVA. Results: There were 127, 182, 40, and 110 DNAm sites that were uniquely associated with LDL-C, non-HDL-C, LDL-P, and apoB, respectively. There were 114 DNAm sites associated with 3 or more of these atherogenic lipid measures. Of note, 6 DNAm sites were in the promoter of LDLR. Shared pathways included cholesterol and fatty acid metabolism, steroid and alcohol biosynthesis, as well as cellular protein transport (Table).Unique pathways generally included cholesterol synthesis for LDL-C, and energy metabolism, inflammation, and calcium transport for apoB and LDL-P. In total, identified CpGs in circulating blood leukocytes explained 14%, 24%, 16%, and 17% variance in LDL-C, non-HDL-C, LDL-P, and apoB, respectively. Conclusions: Assessment of longitudinal epigenetic patterns in peripheral leukocytes suggest unique and shared pathways mediate a large % variance in atherogenic lipids. Further exploration of the function of these DNAm sites may enhance mechanistic insight into the determinants of atherogenic lipid exposure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».