Abstract 4142283: Opposing Responses to Oxygen in the Rabbit Ductus Arteriosus and Fetal Pulmonary Arteries: Proteomic Analysis Reveals Significant Metabolic Differences
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: The ductus arteriosus (DA) is a fetal vessel connecting the pulmonary artery (PA) and aorta, diverting oxygenated blood away from the developing lungs to the systemic circulation. Following the first breath, the DA rapidly constricts in response to increased arterial oxygen (O 2 ) which simultaneously induces relaxation of small resistance pulmonary arteries (rPA). These changes, vital for adaptation to neonatal life, separate the pulmonary and systemic circulations (DA vasoconstriction) and enable adequate perfusion of newly ventilated lungs (PA vasodilation). The underlying mechanism of these opposite O 2 responses is not fully understood. A failure of either vessel to appropriately respond to O 2 results in clinical complications, notably persistent ductus arteriosus or persistent pulmonary hypertension of the newborn. To examine the underlying differences in these fetal vessels, we performed proteomics on fetal rabbit DA and rPA. Methods: DA and rPA were isolated from male (n=4) and female (n=4) term (30 days gestation) fetal New Zealand white rabbits (protocol #2021-2122). Extracted protein was labelled with TMTpro mass tag labeling. Following HPLC fractionation, samples were run on the ThermoFisher Orbitrap Eclipse Mass Spectrometer. Analysis was completed using ThermoFisher Proteome Discoverer software and DESeq2. Results: There were 3103 significantly, differentially expressed proteins between the DA and PA(Benjamini Hochberg adjusted p<0.05), 232 of which were ±1.5-fold differentially expressed ( Figure 1 ). Using KEGG pathway analysis the most significantly DA enriched pathway is “Starch and sucrose metabolism” (map00500) and the most significantly rPA enriched pathway is “Sulfur Metabolism” (map00920). There was also rPA enrichment of other metabolic pathways including “Fatty Acid Degradation” (map00071), “Pyruvate Metabolism” (map00620), and “Glycolysis/Gluconeogenesis” (map00010). Conclusions: This analysis reveals unique mitochondrial metabolic pathways that may contribute to the opposing tissue responses of these specialized blood vessels to O 2 . Exploration of these pathways may identify potential therapeutic targets and inform future investigations of differential O 2 sensing in DA and rPA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».