MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4404363358 · doi:10.1161/circ.150.suppl_1.4141501

Abstract 4141501: 9p21.3 variants drive coronary calcification by suppressing statherin expression

2024· article· en· W4404363358 sur OpenAlexaff
Fariborz Soheili, Naif A. M. Almontashiri, Niloufar Heydarikhorneh, Ragnar O. Vilmundarson, Hsiao‐Huei Chen, Alexandre F.R. Stewart

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCalcificationExpression (computer science)CardiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Genetic variants on chromosome 9 at p21.3 confer a heightened risk of atherosclerosis and coronary artery calcification. The 9p21.3 variants cause the selective expression of non-coding RNA transcripts (ANRIL) that regulate many genes through ALU element mediated silencing. However, to date, none of these regulated genes account for the effect of 9p21.3 variants on coronary calcification. Methods and Results: To identify genes differentially regulated by the 9p21.3 risk variants, primary human aortic smooth muscle cells (HAoSMCs) from 11 different donors genotyped for 9p21.3 risk variants (n=3-4/genotype) were analyzed for whole-genome expression using microarrays. We identified the mRNA for the hydroxyapatite-binding protein statherin as the most impacted by 9p21.3 genotypes—its mRNA was silenced in carriers homozygous for risk variants. Transfection of ANRIL with an expression plasmid bearing the ALU element from the first intron of the Statherin gene silenced statherin expression. HAoSMCs also express another hydroxyapatite binding protein called matrix GLA protein (MGP). Mice lack a native statherin gene, and if they lose the Mgp gene, they develop severe arterial calcification and die of aortic rupture. In contrast, humans with MGP deficiency (aka Keutel syndrome) rarely develop calcified arteries, suggesting that statherin might compensate for MGP loss. As has been reported for MGP, statherin was found to inhibit bone morphogenic protein 4 (BMP4)-dependent activation of a BMP-responsive luciferase reporter, suggesting functional redundancy of statherin and MGP to inhibit arterial calcification. Lentiviral vectors expressing human statherin blocked calcification of primary aortic smooth muscle cells from Mgp KO mice. Furthermore, expression of human statherin from a transgene conditionally recombined only in smooth muscle cells prevented arterial calcification in Mgp KO mice. Conclusion: The 9p21.3 risk variants expedite arterial calcification by suppressing statherin expression. Since microcalcifications hasten atherosclerosis, targeting this statherin-dependent mechanism could reduce atherosclerotic burden and benefit up to 75% of individuals of European and Asian ancestry that carry the 9p21.3 risk variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCirculationMême sujetProtein Tyrosine PhosphatasesTravaux en français237 207