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Enregistrement W4404363956 · doi:10.1161/circ.150.suppl_1.4139461

Abstract 4139461: Proteomic and Phosphoproteomic Profiling in an Experimental Model of Electrical Storm

2024· article· en· W4404363956 sur OpenAlexaff
Yukiomi Tsuji, Masafumi Shimojo, Satoshi Yanagisawa, Yasuya Inden, Dobromir Dobrev, Stanley Nattel, Toyoaki Murohara

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineProfiling (computer programming)Computational biologyStormProteomicsBioinformaticsBiochemistryBiologyOceanographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Electrical storm (ES), characterized by clustered ventricular tachycardia/fibrillation (VT/VF) episodes, is a major problem with substantial mortality in patients with implantable cardioverter-defibrillators (ICDs) and ischemic/non-ischemic cardiomyopathy, but available therapeutic approach is suboptimal, likely due to incomplete understanding of the pathophysiology. Objective: To identify the cardiac-specific features of protein/phosphoprotein changes in experimental ES. Methods: The model was created by inducing chronic complete atrioventricular-block in ICD-implanted rabbits, causing hypertrophy, QT prolongation, and frequent VT/VF-episodes. Relative protein/phosphoprotein abundances in hearts from 4 rabbits with ES (defined as ≥3 VF-episodes/24-hr period) experiencing 97±27 VF-episodes and 4 controls (CTL) were assessed by iTRAQ LC-MS/MS and key regulatory pathways were examined by Ingenuity-Pathway-Analysis. Results: Proteomic analysis identified 1938 proteins, 106 of which were differentially expressed between ES and CTL (False Discovery Rate (FDR)<0.1). ES was profoundly associated with mitochondrial dysfunction, oxidative phosphorylation inactivation and ATP depletion along with decreased measurement of electron transport chain and ATP synthase proteins and inner membrane-localized transporters and enzymes. Reductions in mitochondrial matrix-enzymes inferred downregulation of fatty acid β-oxidation and TCA cycle. Phosphoproteome detected 641 phosphorylated proteins, 82 of which have changes in phosphorylation state in ES versus CTL (FDR<0.1). Hyperphosphorylation of Z-disc proteins/associated proteins of sarcomeres, especially N-terminals of titin, and actin and protein kinase A subunits predicted striated muscle contraction and integrin signaling activation, which in part explain cardiac dilation with enhanced contractility due to sustained bradycardia in this model. Nuclear integrators for mitochondrial biogenesis and function, including cyclic AMP-response element binding, peroxisome proliferative activated receptor gamma, coactivator 1 alpha and nuclear respiratory factor 1, were activated, the prediction opposite to proteomic data. The activation status of other pathways linked to heart failure was undeterminable. Conclusion: ES is associated with evidence of mitochondrial dysfunction, known to contribute to ventricular dysfunction and arrhythmogenesis. Mitochondria-targeted agents merit further investigations as therapeutic targets in ES.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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