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Enregistrement W4404365696 · doi:10.3389/fnana.2024.1477973

Differential effects of prolonged post-fixation on immunohistochemical and histochemical staining for postmortem human brains

2024· article· en· W4404365696 sur OpenAlexafffund
Weiya Ma, Éve‐Marie Frigon, Josefina Maranzano, Yashar Zeighami, Mahsa Dadar

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroanatomy · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité du Québec à Trois-RivièresMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeuNStainingLuxol fast blue stainGlial fibrillary acidic proteinImmunohistochemistryPathologyCresyl violetFixation (population genetics)BiologyAstrocyteMedicineMyelinCentral nervous systemEndocrinologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: Immunohistochemical (IHC) and histochemical (HC) staining techniques are widely used on human brains that are post-fixed in formalin and stored in brain banks worldwide for varying durations, from months to decades. Understanding the effects of prolonged post-fixation, postmortem interval (PMI), and age on these staining procedures is important for accurately interpreting their outcomes, thereby improving the diagnosis and research of brain disorders afflicting millions of people worldwide. Methods: In this study, we conducted both IHC and HC staining on the prefrontal cortex of postmortem human brains post-fixed for 1, 5, 10, 15, and 20 years. For IHC staining, we used two antibodies for each marker: the neuron marker neuronal nuclear antigen (NeuN), the astrocyte marker glial fibrillary acidic protein (GFAP), and the microglia marker ionized calcium-binding adaptor molecule 1 (Iba1). For HC staining, we conducted hematoxylin and eosin Y (H&E), cresyl violet (CV), and Luxol fast blue (LFB) stains to examine neuropils, neurons, and myelin, respectively. Results: We observed that the intensity of NeuN, Iba1, CV, or LFB staining was negatively correlated with post-fixation durations. Conversely, we detected a positive correlation between the intensity of GFAP and H&E staining and post-fixation durations. Moreover, there was no correlation between the intensity of NeuN, GFAP, Iba1, H&E, CV, and LFB staining and PMI. Additionally, no correlation was found between these staining intensities and age, except for the intensity of GFAP immunostained by one antiserum, which was negatively correlated with age. Conclusion: Taken together, these findings suggest that prolonged post-fixation has both positive and negative effects, while age and PMI exert limited influence on these IHC and HC parameters. Therefore, it is essential to consider these differential changes when interpreting results derived from tissues with extended post-fixation durations. Furthermore, if feasible, we recommend conducting IHC and HC staining on human brains with the same post-fixation time spans and using the most optimal antibodies to mitigate the impact on subsequent analyses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,568

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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