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Enregistrement W4404378177 · doi:10.3390/ijms252212233

Drug Discovery in the Age of Artificial Intelligence: Transformative Target-Based Approaches

2024· review· en· W4404378177 sur OpenAlexaff
Akshata Yashwant Patne, Sai Madhav Dhulipala, William F. Lawless, Satya Prakash, Shyam S. Mohapatra, Subhra Mohapatra

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2024
Typereview
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésTransformative learningDrug discoveryData scienceArtificial intelligenceComputational biologyComputer sciencePsychologyBiologyBioinformaticsDevelopmental psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The complexities inherent in drug development are multi-faceted and often hamper accuracy, speed and efficiency, thereby limiting success. This review explores how recent developments in machine learning (ML) are significantly impacting target-based drug discovery, particularly in small-molecule approaches. The Simplified Molecular Input Line Entry System (SMILES), which translates a chemical compound's three-dimensional structure into a string of symbols, is now widely used in drug design, mining, and repurposing. Utilizing ML and natural language processing techniques, SMILES has revolutionized lead identification, high-throughput screening and virtual screening. ML models enhance the accuracy of predicting binding affinity and selectivity, reducing the need for extensive experimental screening. Additionally, deep learning, with its strengths in analyzing spatial and sequential data through convolutional neural networks (CNNs) and recurrent neural networks (RNNs), shows promise for virtual screening, target identification, and de novo drug design. Fragment-based approaches also benefit from ML algorithms and techniques like generative adversarial networks (GANs), which predict fragment properties and binding affinities, aiding in hit selection and design optimization. Structure-based drug design, which relies on high-resolution protein structures, leverages ML models for accurate predictions of binding interactions. While challenges such as interpretability and data quality remain, ML's transformative impact accelerates target-based drug discovery, increasing efficiency and innovation. Its potential to deliver new and improved treatments for various diseases is significant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,789
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0060,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,115
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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