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Enregistrement W4404387004 · doi:10.1016/j.virol.2024.110299

3C-like proteases at the interface of plant-virus-vector interactions: Focus on potyvirid NIa proteases and secovirid proteases

2024· review· en· W4404387004 sur OpenAlexafffund
Hélène Sanfaçon

Notice bibliographique

RevueVirology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésProteasesBiologyFocus (optics)BiochemistryInterface (matter)Enzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant viruses of the families Potyviridae and Secoviridae encode 3C-like proteases (3CL pro ) that are related to picornavirus 3C proteases. This review discusses recent advances in deciphering the multifunctional activities of plant virus 3CL pro . These proteases regulate viral polyprotein processing and facilitate virus replication. They are also determinants of host range, virulence, symptomatology and super-infection exclusion in some plant-virus interactions and facilitate aphid transmission. Potyvirid NIa-Pro proteases interact with host factors to interfere with a variety of defense mechanisms: salicylic acid-dependent signaling, ethylene-dependent signaling, transcriptional gene silencing and RNA decay. Potyvirid NIa-Pro also cleave host proteins at signature cleavage sites, although the biological impact of these cleavage remains to be determined. Recently, a plant defense mechanism was uncovered that inhibits the proteolytic activity of a comovirus 3CL pro . Future perspectives are discussed including using proteomic and degradomic techniques to elucidate the network of interactions of plant virus 3CL pro with the host proteome. • Potyvirids and secovirids encode proteases related to picornavirus 3C protease. • Potyvirid NIa-Pro counteract plant defenses targeted at the virus or their vector. • The NIa-Pro of three potyviruses cleave a variety of host proteins. • A plant antiviral mechanism inhibits the activity of a comovirus protease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,908
Score d'incertitude au seuil0,829

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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