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Enregistrement W4404394810 · doi:10.3897/phytokeys.249.133205

Morphological and molecular characterization of Halamphora vantushpaensis (Bacillariophyceae, Amphipleuraceae), a new diatom species widely dispersed on the shores of the soda Lake Van (Türkiye)

2024· article· en· W4404394810 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePhytoKeys · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesGeneralitat de CatalunyaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentres de Recerca de CatalunyaRural and Environment Science and Analytical Services Division
Mots-clésBiologyGenomeMitochondrial DNADiatomGenePlastidNuclear geneCladeEvolutionary biologyPhylogenetic treePhylogeneticsGeneticsBotanyChloroplast

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, we describe Halamphora vantushpaensis sp. nov. , a newly identified diatom species found in the highly alkaline Lake Van in Eastern Turkey (Türkiye). This new species is characterized morphologically by light and scanning electron microscopy, performed on both wild and cultivated samples. Two monoclonal cultures were submitted to a genome-skimming approach, giving access to the complete sequence of their nuclear rRNA cluster of genes, mitochondrial and plastid genomes. Both strains were highly similar from the genomic point of view, with few mutations noted, although in organellar genomes some of them concerned protein coding genes and were non-silent. Also, the group II intron in the mitochondrial cox1 gene was found to display a relatively high number of polymorphisms. The plastome also distinguishes itself from other Halamphora spp. by the extension of its inverted repeat at the expense of the two single copy regions of the genome. Maximum likelihood molecular phylogeny inferred from a concatenated three genes dataset (18S , psbC and rbcL ) positions this species within the K clade, which is known to contain hypersaline to freshwater species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,700

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle