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Enregistrement W4404394935 · doi:10.1016/j.heliyon.2024.e40452

Deep learning-driven macroscopic AI segmentation model for brain tumor detection via digital pathology: Foundations for terahertz imaging-based AI diagnostics

2024· article· en· W4404394935 sur OpenAlexaff
Myeong Suk Yim, Y. H. Kim, Hyeon Sang Bark, Seung Jae Oh, Inhee Maeng, Jin‐Kyoung Shim, Jong Hee Chang, Seok‐Gu Kang, Byeong Cheol Yoo, Jang-Woo Kwon, Jungsup Byun, Woon-Ha Yeo, Seunghwan Jung, Han‐Cheol Ryu, Se Hoon Kim, Hyun Ju Choi, Young Bin Ji

Notice bibliographique

RevueHeliyon · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensNexen (Canada)
Organismes subventionnairesInstitute for Information and Communications Technology PromotionMinistry of Science and ICT, South KoreaChungnam National University HospitalGwangju Institute of Science and Technology
Mots-clésTerahertz radiationArtificial intelligenceDeep learningSegmentationDigital pathologyNeuroimagingMedical imagingComputer scienceBiomedical engineeringNeuroscienceMedicinePhysicsOpticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We used deep learning methods to develop an AI model capable of autonomously delineating cancerous regions in digital pathology images (H&E-stained images). By using a transgenic brain tumor model derived from the TS13-64 brain tumor cell line, we digitized a total of 187 H&E-stained images and annotated the cancerous regions in these images to compile a dataset. A deep learning approach was executed through DEEP:PHI, which abstracts Python coding complexities, thereby simplifying the execution of AI training protocols for users. By employing the Image Crop with Mask technique and patch generation method, we not only maintained an appropriate data class balance but also overcame the challenge of limited computing resources. This approach enabled us to successfully develop an AI training model that autonomously segments cancerous areas. This AI model enables the provision of guiding images for determining cancerous areas with minimal assistance from neuropathologists. In addition, the high-quality, large dataset curated for training using the proposed approach contributes to the development of novel terahertz imaging-based AI cancer diagnosis technologies and accelerates technological advancements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,969
Score d'incertitude au seuil0,837

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
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Résumé présentoui

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