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Enregistrement W4404408828 · doi:10.1016/j.esmoop.2024.103978

Bespoke ctDNA for longitudinal detection of molecular residual disease in high-risk melanoma patients

2024· article· en· W4404408828 sur OpenAlexaff
Sofia Genta, Daniel Vilarim Araújo, Katrina Hueniken, Christodoulos Pipinikas, Rodolfo Ventura, Patricia Rojas, Gail Jones, Marcus O. Butler, Samuel D. Saibil, Celeste Yu, Alexandra Easson, A. Covelli, Maxwell Sauder, Charles Fournier, Zaid Saeed Kamil, Patrik Rogalla, Diana P. Arteaga, Olga Vornicova, Pavlina Spiliopoulou, Thiago Pimentel Muniz, Lillian L. Siu, Anna Spreafico

Notice bibliographique

RevueESMO Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensAbbotsford Veterinary ClinicPrincess Margaret Cancer CentreBC Cancer AgencyUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBespokeMelanomaResidualResidual riskMedicineInternal medicineOncologyDermatologyCancer researchComputer scienceBusinessAlgorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Locally advanced melanoma has a variable prognosis. Currently, there are no reliable criteria to stratify the risk of disease relapse and identify those patients who will benefit the most from adjuvant therapies. Circulating tumor DNA (ctDNA) is an emerging biomarker measuring the presence of tumor-derived DNA in blood. PATIENTS AND METHODS: We used a bespoke, tumor-informed assay (RaDaR®, NeoGenomics, Inc.) to detect ctDNA in 276 prospectively collected plasma samples from 66 melanoma patients receiving definitive treatment. Collection time points included landmark (after completion of local treatment) and every 3-6 months for up to 2 years. RESULTS: ctDNA was detected in at least one plasma sample in 19 patients (29%), including 6/65 (9%) at landmark (post-surgical sample). Positive ctDNA at landmark was associated with shorter overall survival (OS; median OS 22.7 months versus not reached, log-rank P value = 0.01) and a trend towards a shorter relapse-free survival (RFS; median RFS 15.7 months versus not reached, log-rank P value = 0.07). In 10 patients, ctDNA detection preceded disease relapse by a median of 128 days (range 8-406 days). CONCLUSIONS: Our data indicate that ctDNA detection after surgery can identify patients with worse prognosis, and serial ctDNA measurements may enable earlier identification of disease recurrence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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