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Enregistrement W4404421282 · doi:10.1016/j.jbo.2024.100649

A patch-based deep learning MRI segmentation model for improving efficiency and clinical examination of the spinal tumor

2024· article· en· W4404421282 sur OpenAlexaff
Weimin Chen, Yong Chol Han, Muhammad Awais Ashraf, Junhan Liu, Mu Zhang, Feng Su, Zhiguo Huang, Kelvin K. L. Wong

Notice bibliographique

RevueJournal of bone oncology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMedical Imaging and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesXiangya Hospital, Central South UniversityCentral South University
Mots-clésMedicineSegmentationDeep learningMagnetic resonance imagingRadiologyMedical physicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and objective: Magnetic resonance imaging (MRI) plays a vital role in diagnosing spinal diseases, including different types of spinal tumors. However, conventional segmentation techniques are often labor-intensive and susceptible to variability. This study aims to propose a full-automatic segmentation method for spine MRI images, utilizing a convolutional-deconvolution neural network and patch-based deep learning. The objective is to improve segmentation efficiency, meeting clinical needs for accurate diagnoses and treatment planning. Methods: The methodology involved the utilization of a convolutional neural network to automatically extract deep learning features from spine data. This allowed for the effective representation of anatomical structures. The network was trained to learn discriminative features necessary for accurate segmentation of the spine MRI data. Furthermore, a patch extraction (PE) based deep neural network was developed using a convolutional neural network to restore the feature maps to their original image size. To improve training efficiency, a combination of pre-training and an enhanced stochastic gradient descent method was utilized. Results: The experimental results highlight the effectiveness of the proposed method for spine image segmentation using Gadolinium-enhanced T1 MRI. This approach not only delivers high accuracy but also offers real-time performance. The innovative model attained impressive metrics, achieving 90.6% precision, 91.1% recall, 93.2% accuracy, 91.3% F1-score, 83.8% Intersection over Union (IoU), and 91.1% Dice Coefficient (DC). These results indicate that the proposed method can accurately segment spine tumors CT images, addressing the limitations of traditional segmentation algorithms. Conclusion: In conclusion, this study introduces a fully automated segmentation method for spine MRI images utilizing a convolutional neural network, enhanced by the application of the PE-module. By utilizing a patch extraction based neural network (PENN) deep learning techniques, the proposed method effectively addresses the deficiencies of traditional algorithms and achieves accurate and real-time spine MRI image segmentation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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