MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4404427231 · doi:10.1002/ana.27089

Automated and Interpretable Detection of Hippocampal Sclerosis in Temporal Lobe Epilepsy: <scp>AID</scp> ‐ <scp>HS</scp>

2024· article· en· W4404427231 sur OpenAlexafffund
Mathilde Ripart, Jordan DeKraker, Maria H. Eriksson, Rory J. Piper, Siby Gopinath, Harilal Parasuram, Jiajie Mo, Marcus Likeman, Georgian Ciobotaru, Philip Sequeiros‐Peggs, Khalid Hamandi, Hua Xie, Nathan T. Cohen, Ting‐Yu Su, Ryuzaburo Kochi, Irène Wang, Gonzalo Rojas, Marcelo Gálvez, Costanza Parodi, Antonella Riva, Felice D’Arco, Kshitij Mankad, Chris A. Clark, Adrián Valls Carbó, Rafael Toledano, Peter N. Taylor, Antonio Napolitano, Maria Camilla Rossi‐Espagnet, Anna Willard, Benjamin Sinclair, Joshua Pepper, Stefano Seri, Orrin Devinsky, Heath Pardoe, Gavin P. Winston, John S. Duncan, Clarissa Lin Yasuda, Lucas Scárdua Silva, Lennart Walger, Theodor Rüber, Ali R. Khan, Torsten Baldeweg, Sophie Adler, Konrad Wagstyl

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensWestern UniversitySickKids FoundationQueen's UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesNIHR Great Ormond Street Hospital Biomedical Research CentreFondo Nacional de Desarrollo Científico y TecnológicoMedical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEpilepsy Research UKCanada Research ChairsNational Institutes of HealthHealth and Care Research WalesMinistero dell'Università e della RicercaNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute for Health and Care ResearchGreat Ormond Street Hospital CharityRosetrees TrustCanadian Institutes of Health ResearchSigrid Juséliuksen SäätiöWellcome Trust
Mots-clésHippocampal sclerosisTemporal lobeMagnetic resonance imagingEpilepsyHippocampal formationMedicineCohortPsychologyMultiple sclerosisPathologyRadiologyNeuroscienceInternal medicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Hippocampal sclerosis (HS), the most common pathology associated with temporal lobe epilepsy (TLE), is not always visible on magnetic resonance imaging (MRI), causing surgical delays and reduced postsurgical seizure-freedom. We developed an open-source software to characterize and localize HS to aid the presurgical evaluation of children and adults with suspected TLE. METHODS: We included a multicenter cohort of 365 participants (154 HS; 90 disease controls; 121 healthy controls). HippUnfold was used to extract morphological surface-based features and volumes of the hippocampus from T1-weighted MRI scans. We characterized pathological hippocampi in patients by comparing them to normative growth charts and analyzing within-subject feature asymmetries. Feature asymmetry scores were used to train a logistic regression classifier to detect and lateralize HS. The classifier was validated on an independent multicenter cohort of 275 patients with HS and 161 healthy and disease controls. RESULTS: HS was characterized by decreased volume, thickness, and gyrification alongside increased mean and intrinsic curvature. The classifier detected 90.1% of unilateral HS patients and lateralized lesions in 97.4%. In patients with MRI-negative histopathologically-confirmed HS, the classifier detected 79.2% (19/24) and lateralized 91.7% (22/24). The model achieved similar performances on the independent cohort, demonstrating its ability to generalize to new data. Individual patient reports contextualize a patient's hippocampal features in relation to normative growth trajectories, visualise feature asymmetries, and report classifier predictions. INTERPRETATION: Automated and Interpretable Detection of Hippocampal Sclerosis (AID-HS) is an open-source pipeline for detecting and lateralizing HS and outputting clinically-relevant reports. ANN NEUROL 2024.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnnals of NeurologyMême sujetEpilepsy research and treatmentTravaux en français237 207