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Enregistrement W4404429315 · doi:10.1101/2024.11.13.623440

An integrative layer-resolved atlas of the adult human meninges

2024· preprint· en· W4404429315 sur OpenAlexaff
Theresa Degenhard, Adam M.R. Groh, Elia Afanasiev, Michael Luo, Moein Yaqubi, Jo Anne Stratton, Kevin Petrecca

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOptical Imaging and Spectroscopy Techniques
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeningesAtlas (anatomy)Layer (electronics)NeuroscienceAnatomyBiologyNanotechnologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The human meninges are a dynamic tri-layered brain border that plays a key role in brain development, CSF homeostasis, immune regulation, and higher-level brain function. The meninges have also been implicated in central nervous system (CNS) pathologies such as infection, autoimmunity, and brain trauma. To understand how the meningeal microenvironment is altered under pathological conditions it is necessary to have a complete understanding of its normotypic cellular architecture and function. To date, there is no complete atlas of the normotypic adult human meninges. By surgically extracting each human meningeal layer during surgery, we generated the first layer-resolved map of all meningeal cell types via an integration of whole cell single cell RNA sequencing, multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization (MERFISH), and protein immunolabelling. Since fibroblasts play key roles in meningeal homeostasis yet remain less well-characterised than other meningeal cell types, we deeply phenotyped these cells in all layers. We identified 10 fibroblast subpopulations with unique predicted functions that localise to distinct neuroanatomical niches. Fibroblast interaction analysis in the dura and subarachnoid space (SAS) uncovered novel interactions with vascular cell populations mediated by insulin growth factor signaling. Together, these data serve as a comprehensive resource for future investigations of meningeal function in the healthy and diseased brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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