MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4404434425 · doi:10.1093/lambio/ovae113

Bacterial composition and cultural dynamics of microgreens-associated microbiota during selective enrichment for <i>Listeria monocytogenes</i>

2024· article· en· W4404434425 sur OpenAlexafffund
Laura S. E. Haniford, Forest Dussault, Julie A. Shay, Ashley Cooper, Burton W. Blais, Calvin Ho‐Fung Lau

Notice bibliographique

RevueLetters in Applied Microbiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesCanadian Food Inspection Agency
Mots-clésListeria monocytogenesBiologyListeriaBacteriaGammaproteobacteriaFood sciencePopulationMicrobiomeEnterococcusMicrobiology16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Widely regarded as a so-called "superfood," microgreens have become an increasingly significant food crop from both nutritional and agricultural standpoints. However, similar to other produce commodities that are also cultivated using modernized indoor farming methods, there have been mounting concerns over the potential risks of consuming microgreens contaminated by Listeria monocytogenes. To gain insights into the microbial properties of microgreens, this study characterized the bacterial composition of fresh microgreen retail products using amplicon sequencing of 16S rRNA genes. Dominated by Gammaproteobacteria, a total of 36 shared genera were identified as putative constituents of the microgreen core microbiome. By monitoring the dynamics of microgreen-borne bacteria undergoing a Listeria-selective cultural enrichment procedure, it was revealed that, regardless of the presence or absence of L. monocytogenes, off-target bacteria of the Klebsiella and Enterococcus genera were significantly enriched from microgreens by the primary enrichment step, with the secondary enrichment step continuing to promote the expansion of Enterococcus population. While Listeria was generally neither the most-enriched nor the dominant taxon in cultures sampled at different enrichment stages, significant enrichment of Lysinibacillus and Bacillus bacteria was detected in microgreens contaminated with L. monocytogenes, suggesting they could be co-enriched in competition with Listeria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLetters in Applied MicrobiologyMême sujetListeria monocytogenes in Food SafetyTravaux en français237 207