Bayesian optimization for personalized dose-finding trials with combination therapies
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Identification of optimal dose combinations in early-phase dose-finding trials is challenging, due to the trade-off between precisely estimating the many parameters required to flexibly model the possibly nonmonotonic dose-response surface, and the small sample sizes in early-phase trials. This difficulty is even more pertinent in the context of personalized dose-finding, where patient characteristics are used to identify tailored optimal dose combinations. To overcome these challenges, we propose the use of Bayesian optimization for finding optimal dose combinations in standard (one size fits all) and personalized multi-agent dose-finding trials. Bayesian optimization is a method for estimating the global optima of expensive-to-evaluate objective functions. The objective function is approximated by a surrogate model, commonly a Gaussian process, paired with a sequential design strategy to select the next point via an acquisition function. This work is motivated by an industry-sponsored problem, where the focus is on optimizing a dual-agent therapy in a setting featuring minimal toxicity. To compare the performance of the standard and personalized methods under this setting, simulation studies are performed for a variety of scenarios. Our study concludes that taking a personalized approach is highly beneficial in the presence of heterogeneity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,029 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».