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Enregistrement W4404444524 · doi:10.1093/noajnl/vdae200

Machine learning prediction of brain metastasis invasion pattern on brain magnetic resonance imaging scans

2024· article· en· W4404444524 sur OpenAlexafffund
Keyhan Najafian, Benjamin Rehany, Alexander Nowakowski, Saba Ghazimoghadam, Kevin Pierre, Rita Zakarian, Tariq Al‐Saadi, Caroline Reinhold, Abbas Babajani‐Feremi, Joshua K. Wong, Marie‐Christine Guiot, Stéphanie Lam, Peter M. Siegel, Kevin Petrecca, Matthew Dankner, Reza Forghani

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBrain Metastases and Treatment
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill UniversityUniversité de MontréalUniversity of SaskatchewanMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Health, University of SydneyFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaFondation de l'Association des radiologistes du QuébecGovernment of CanadaFondation Brain CanadaMcGill University
Mots-clésBrain metastasisArtificial intelligenceComputer scienceNeuroscienceMedicineMetastasisPsychologyInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Brain metastasis invasion pattern (BMIP) is an emerging biomarker associated with recurrence-free and overall survival in patients, and differential response to therapy in preclinical models. Currently, BMIP can only be determined from the histopathological examination of surgical specimens, precluding its use as a biomarker prior to therapy initiation. The aim of this study was to investigate the potential of machine learning (ML) approaches to develop a noninvasive magnetic resonance imaging (MRI)-based biomarker for BMIP determination. Methods: From an initial cohort of 329 patients, a subset of 132 patients met the inclusion criteria for this retrospective study. We evaluated the ability of an expert neuroradiologist to reliably predict BMIP. Thereafter, the dataset was randomly divided into training/validation (80% of cases) and test subsets (20% of cases). The ground truth for BMIP was the histopathologic evaluation of resected specimens. Following MRI sequence co-registration, advanced feature extraction techniques deriving hand-crafted radiomic features with traditional ML classifiers and convolution-based deep learning (CDL) models were trained and evaluated. Different ML approaches were used individually or using ensembling techniques to determine the model with the best performance for BMIP prediction. Results: Expert evaluation of brain MRI scans could not reliably predict BMIP, with an accuracy of 44%-59% depending on the semantic feature used. Among the different ML and CDL models evaluated, the best-performing model achieved an accuracy of 85% and an F1 score of 90%. Conclusions: ML approaches can effectively predict BMIP, representing a noninvasive MRI-based approach to guide the management of patients with brain metastases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil0,789

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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